More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3187 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  100 
 
 		 454 aa  897    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  54.1 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  52.9 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  51.34 
 
 		 453 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  52.01 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  50.33 
 
 		 467 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  49.46 
 
 		 463 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2708  beta-lactamase  41.65 
 
 		 417 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01490  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.16 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.697704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  34.69 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.8 
 
 		 524 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.23 
 
 		 389 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30.56 
 
 		 498 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  30.19 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.86 
 
 		 501 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  28.62 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.01 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  28.91 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.91 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  28.91 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  28.91 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.82 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.32 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  28.91 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  28.57 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  30.3 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.23 
 
 		 578 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.95 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.79 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.07 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.32 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.92 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  28.95 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.33 
 
 		 388 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  29.32 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  32.81 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  27.06 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  33.82 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.09 
 
 		 487 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.83 
 
 		 470 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  30.32 
 
 		 590 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.46 
 
 		 385 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.26 
 
 		 353 aa  96.3  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.99 
 
 		 388 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.16 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  28.94 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.73 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  27.99 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  27.99 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  27.99 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.99 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 		 388 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  22.77 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  32.09 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  29.45 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  27.99 
 
 		 456 aa  92.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  29.48 
 
 		 455 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.57 
 
 		 497 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  33.21 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  31.79 
 
 		 429 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30360  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.84 
 
 		 550 aa  91.3  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  29.11 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.92 
 
 		 505 aa  89.7  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  25 
 
 		 614 aa  89.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  26.25 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  22.81 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  30.77 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.93 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  25.47 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.02 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.9 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.13 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.22 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.98 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.03 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.86 
 
 		 421 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  31.58 
 
 		 740 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  23.01 
 
 		 485 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3436  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.13 
 
 		 381 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.49 
 
 		 488 aa  87  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  28.97 
 
 		 580 aa  86.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  25.82 
 
 		 486 aa  86.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  30.58 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  27.44 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  26.64 
 
 		 720 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  23.97 
 
 		 342 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25.15 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  33.68 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  27.55 
 
 		 507 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  24.34 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.39 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.54 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  28.8 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.25 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  26.19 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.48 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.78 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  23.1 
 
 		 485 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>