More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3866 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3866  beta-lactamase  100 
 
 		 388 aa  811    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  31.1 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  30.73 
 
 		 411 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  30.26 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  30 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  28.65 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  29.74 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.98 
 
 		 582 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  26.53 
 
 		 613 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  27.71 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  28.99 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  27.41 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  27.65 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  26.87 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  26.93 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  26.9 
 
 		 445 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  27.94 
 
 		 447 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  26.15 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  26.67 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  27.61 
 
 		 966 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  27.69 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  26.53 
 
 		 440 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 421 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 412 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  25.82 
 
 		 418 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 412 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  26.4 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.03 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  26.12 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.03 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  26.29 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  24.45 
 
 		 574 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  27.27 
 
 		 717 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  24.07 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  30.2 
 
 		 415 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  27.64 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  27.39 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  29.87 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  26.87 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  30.2 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  29.37 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  29.11 
 
 		 792 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  26.84 
 
 		 793 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  24.57 
 
 		 408 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  27.42 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  25.78 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  24.32 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  32.66 
 
 		 848 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  28.12 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  27.33 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  27.33 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  26.18 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  27.97 
 
 		 784 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  24.87 
 
 		 407 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  26.68 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  26.56 
 
 		 435 aa  99.8  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  28.15 
 
 		 785 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  27.67 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  26.32 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  25.44 
 
 		 566 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  28.18 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  25.54 
 
 		 511 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  30.04 
 
 		 453 aa  97.1  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  28.68 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  25.42 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  26.46 
 
 		 483 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  26.67 
 
 		 459 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  24.57 
 
 		 381 aa  96.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  24.41 
 
 		 381 aa  96.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  28.77 
 
 		 459 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  25.46 
 
 		 408 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  26.38 
 
 		 357 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  28.57 
 
 		 519 aa  96.3  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  29.77 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  27.84 
 
 		 395 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  26.22 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  24.01 
 
 		 431 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  25.19 
 
 		 454 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.34 
 
 		 487 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  32.56 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  27.41 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  24.3 
 
 		 416 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  27.41 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  26.29 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  25.98 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.41 
 
 		 578 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  26.18 
 
 		 417 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  27.03 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  26.92 
 
 		 424 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  25.45 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  26.2 
 
 		 415 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  25 
 
 		 603 aa  92.8  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  27.13 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  28.42 
 
 		 790 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  27.53 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.56 
 
 		 1018 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  29.12 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  25.07 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  27.89 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>