More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2408 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  100 
 
 		 366 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  51.47 
 
 		 328 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  48.36 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  48.35 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  39.88 
 
 		 380 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  39.88 
 
 		 380 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  28.53 
 
 		 305 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  28.3 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  28.3 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  27.97 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  29.59 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  27.33 
 
 		 305 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  29.08 
 
 		 475 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  27.97 
 
 		 305 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  26.83 
 
 		 387 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.33 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  26.85 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.65 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  27.33 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  31.34 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  31.34 
 
 		 389 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  25.16 
 
 		 598 aa  133  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  26.69 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  28.45 
 
 		 524 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.65 
 
 		 640 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  24.71 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.76 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  33.33 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  31.83 
 
 		 466 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  32.9 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  29.22 
 
 		 505 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  31.95 
 
 		 473 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  32.34 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  31.63 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  31.63 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.91 
 
 		 340 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  28.2 
 
 		 397 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  31.7 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  30.28 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  31.92 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  28.71 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  29.17 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.45 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  30.67 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  29.52 
 
 		 503 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  26.8 
 
 		 530 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  29.25 
 
 		 440 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  31.25 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  28.42 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  26.93 
 
 		 475 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  27.53 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.34 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  30.96 
 
 		 360 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  26.86 
 
 		 530 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  28.91 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.33 
 
 		 476 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  29.34 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  28.06 
 
 		 481 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  24.47 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  28.01 
 
 		 342 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  24.92 
 
 		 315 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  24.09 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.92 
 
 		 315 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  24.92 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  24.77 
 
 		 315 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.32 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  24.77 
 
 		 315 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  27.83 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  29.19 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.67 
 
 		 415 aa  97.1  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  28.16 
 
 		 342 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  29.55 
 
 		 504 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  27.65 
 
 		 443 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  24.27 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  24.59 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  29.55 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  28.12 
 
 		 505 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  26.97 
 
 		 486 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.32 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  29.97 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  26.33 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  28.15 
 
 		 417 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  29.07 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.34 
 
 		 419 aa  92.8  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  30.42 
 
 		 483 aa  92.8  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  30.13 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  28.21 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  26.37 
 
 		 491 aa  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.5 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  29.22 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  24.09 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  29.22 
 
 		 353 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  26.27 
 
 		 455 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  29.3 
 
 		 487 aa  90.5  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  28.71 
 
 		 414 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.66 
 
 		 449 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  27.65 
 
 		 453 aa  89.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.9 
 
 		 391 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  20.74 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  29.55 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>