More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0017 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 468 aa  934    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  48.75 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  42.28 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  41.94 
 
 		 467 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  41.71 
 
 		 467 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  42.38 
 
 		 473 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  42.38 
 
 		 473 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  41.9 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  38.73 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  47.84 
 
 		 481 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  36.47 
 
 		 440 aa  233  6e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  36.24 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  35.51 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  34.97 
 
 		 491 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  35.76 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  35.46 
 
 		 453 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  43.17 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  34.4 
 
 		 459 aa  203  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  34.65 
 
 		 468 aa  203  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  31.99 
 
 		 449 aa  203  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  33.57 
 
 		 472 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  38.82 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  34.27 
 
 		 475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  32.35 
 
 		 522 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  37.01 
 
 		 374 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  31.18 
 
 		 494 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  38.19 
 
 		 459 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  33.26 
 
 		 496 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  32.49 
 
 		 497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  36.33 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  30.7 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  34.04 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  34.7 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  33.43 
 
 		 371 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  33.68 
 
 		 368 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  33.68 
 
 		 368 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  34.24 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  30.13 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  31.21 
 
 		 360 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  33.78 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  32.61 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  31.6 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  30.84 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  31.99 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  27.53 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  31.38 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  30.06 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  27.18 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.97 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.42 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.07 
 
 		 419 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  26.76 
 
 		 305 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.83 
 
 		 640 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  30.77 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.13 
 
 		 396 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  27.08 
 
 		 530 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  28.98 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  26.48 
 
 		 309 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  30.66 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  26.48 
 
 		 309 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  26.78 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  29.02 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  30.41 
 
 		 505 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  28.21 
 
 		 524 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  29.3 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  25.78 
 
 		 305 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  26.83 
 
 		 305 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  26.48 
 
 		 305 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.78 
 
 		 305 aa  96.7  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  26.64 
 
 		 305 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  24.73 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  31.35 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  27.56 
 
 		 530 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  30.56 
 
 		 462 aa  94  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  28.96 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.03 
 
 		 505 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  28.96 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.78 
 
 		 305 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  27.52 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  23.15 
 
 		 395 aa  90.9  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  28.96 
 
 		 374 aa  90.1  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  26.17 
 
 		 390 aa  90.1  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  24 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  25 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  29.65 
 
 		 503 aa  89  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  26.96 
 
 		 486 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.69 
 
 		 415 aa  87.8  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  24.57 
 
 		 598 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  26.03 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.47 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  28.57 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.2 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  26.4 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.2 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  28.81 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  25.99 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.2 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  27.37 
 
 		 417 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.12 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.04 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>