More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1227 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  100 
 
 		 487 aa  961    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  45.68 
 
 		 505 aa  359  5e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  46.23 
 
 		 530 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  47.06 
 
 		 530 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  42.26 
 
 		 486 aa  333  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  49.68 
 
 		 640 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  45.9 
 
 		 483 aa  300  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  53.21 
 
 		 503 aa  292  8e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  48 
 
 		 462 aa  272  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  45.43 
 
 		 504 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  43.15 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  43.14 
 
 		 476 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  32.5 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  32.37 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.66 
 
 		 308 aa  126  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  30.06 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  35.25 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  29.11 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  30.65 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  27.97 
 
 		 598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.13 
 
 		 397 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  25.09 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  24.83 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  32.48 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  24.48 
 
 		 309 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  24.48 
 
 		 309 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  21.3 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.94 
 
 		 396 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.26 
 
 		 419 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  30.13 
 
 		 416 aa  104  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  22.89 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  23.78 
 
 		 305 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  28.48 
 
 		 380 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  28.48 
 
 		 380 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.13 
 
 		 305 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  29.31 
 
 		 356 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  24.41 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  27.92 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.67 
 
 		 340 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  31.58 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  29.2 
 
 		 337 aa  100  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  28.52 
 
 		 335 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  23.78 
 
 		 305 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  25.77 
 
 		 315 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.51 
 
 		 305 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  28.91 
 
 		 328 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  28.19 
 
 		 414 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  28.85 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  24.39 
 
 		 305 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  25.22 
 
 		 363 aa  97.1  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  30.43 
 
 		 338 aa  97.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.77 
 
 		 315 aa  96.7  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  30.19 
 
 		 374 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  22.53 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  29.75 
 
 		 342 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  29.18 
 
 		 342 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  29.02 
 
 		 378 aa  95.1  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.67 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.77 
 
 		 315 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  25.74 
 
 		 315 aa  93.6  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  30.86 
 
 		 466 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  27.3 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  31.21 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  25.81 
 
 		 315 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  25.72 
 
 		 313 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  26.91 
 
 		 371 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  26.97 
 
 		 400 aa  91.3  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  29.97 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  28.79 
 
 		 455 aa  91.3  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  27.24 
 
 		 505 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  24.85 
 
 		 315 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.31 
 
 		 468 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  30 
 
 		 333 aa  89  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  22.94 
 
 		 387 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  29.81 
 
 		 473 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  31.19 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  29.65 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  27.39 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  29.81 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  29.81 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  25.15 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  25.15 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  25 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  28.68 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  32.01 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  29.65 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  25 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  27.12 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.56 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4500  beta-lactamase  25.17 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00711948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  23.45 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  33.76 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  26.85 
 
 		 359 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.79 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  26.5 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  29.02 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  24.77 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  27.18 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  27.27 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.1 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>