141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4500 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4500  beta-lactamase  100 
 
 		 421 aa  863    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00711948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  56.57 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  27.15 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  25.51 
 
 		 505 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  25.48 
 
 		 640 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  24.53 
 
 		 475 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.54 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  25.4 
 
 		 486 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  24.91 
 
 		 305 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  27.51 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  24.15 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  24.15 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  23.63 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  26.39 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  26.39 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  24.15 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  24.15 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  29.43 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  23.63 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  25.33 
 
 		 504 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  24.32 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.47 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  25.32 
 
 		 530 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.81 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  23.4 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  25.22 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.96 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  24.78 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.48 
 
 		 315 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  24.32 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  25.37 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  25.37 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  24.48 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.73 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  25.74 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  24.25 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  24.33 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  27.64 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  24.62 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.8 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  25.38 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  22.93 
 
 		 530 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  24.03 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  24.32 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  24.05 
 
 		 335 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  24.17 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  22.46 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  25.96 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  23.89 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  24.92 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  24.41 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  23.75 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  23.13 
 
 		 598 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.85 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.86 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.85 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  23.88 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  23.22 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.05 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  22.12 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.64 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.85 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.1 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.85 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13543  putative hydrolase transmembrane protein  22.82 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  23.81 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  23.03 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  23.08 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.98 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.44 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.59 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.1 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  22.15 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  23.96 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.81 
 
 		 415 aa  57  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  23.65 
 
 		 459 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.48 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.85 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.23 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  24.54 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.98 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  23.72 
 
 		 346 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  23.93 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.72 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  22.78 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  23.66 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  24.66 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  24.1 
 
 		 362 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  22.15 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  22.89 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  21.9 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03703  hypothetical protein  29 
 
 		 116 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.505696  normal  0.773408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.52 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  26.38 
 
 		 327 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  28.7 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.71 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  22.08 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  23.01 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  28.81 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>