More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5738 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  99.55 
 
 		 447 aa  886    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  99.55 
 
 		 447 aa  886    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  100 
 
 		 447 aa  891    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  48.87 
 
 		 467 aa  359  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.07 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  44.2 
 
 		 416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.02 
 
 		 420 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.02 
 
 		 420 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.69 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.37 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.96 
 
 		 405 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.96 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.96 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  40.83 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.92 
 
 		 420 aa  259  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  39.68 
 
 		 740 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  34.04 
 
 		 713 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.54 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.91 
 
 		 413 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  34.23 
 
 		 349 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.66 
 
 		 399 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  32.18 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  34.36 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  31.61 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  31.34 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  32.11 
 
 		 434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.33 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.9 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.52 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.33 
 
 		 416 aa  161  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  33.53 
 
 		 370 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  32.29 
 
 		 378 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  33.43 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  33.44 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  33.55 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  30.91 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.03 
 
 		 378 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.54 
 
 		 389 aa  153  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  31.66 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.82 
 
 		 414 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  32.51 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  33.12 
 
 		 388 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.12 
 
 		 389 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  33.12 
 
 		 388 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  32.2 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.44 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  33.12 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  33.46 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  33.02 
 
 		 720 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.91 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  33.43 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  32.81 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.7 
 
 		 388 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  34.25 
 
 		 375 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  32.27 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.27 
 
 		 407 aa  146  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.96 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  32.18 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  30.2 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.27 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  32.27 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  30.14 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  30.05 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.95 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.96 
 
 		 388 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  31.5 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.42 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  31.97 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.03 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1885  hypothetical protein  30.25 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1874  hypothetical protein  30.25 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  31.65 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  31.65 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.65 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  31.65 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  30.29 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2565  beta-lactamase  31.53 
 
 		 378 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129252  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.68 
 
 		 514 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  30.93 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.16 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  30.49 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3689  beta-lactamase  28.36 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  29.41 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.45 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  29.85 
 
 		 411 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  29.35 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.75 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  30.19 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.37 
 
 		 373 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  30.54 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  29.39 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  27.01 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  28.18 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2625  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.62 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3305  beta-lactamase  28.77 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0079678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  31.69 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3254  beta-lactamase  28.77 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  32.2 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3243  beta-lactamase  28.77 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>