250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0219 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0219  beta-lactamase  100 
 
 		 367 aa  720    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  27.79 
 
 		 356 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13543  putative hydrolase transmembrane protein  32.7 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2508  beta-lactamase  34.77 
 
 		 336 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.650655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  30.15 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  28.93 
 
 		 396 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3245  beta-lactamase  25.07 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.622434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  20.97 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  22.73 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.82 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  22.56 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  27.03 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  22.56 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  22.56 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  22.56 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  30.04 
 
 		 323 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0777  beta-lactamase  30.71 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0135628  normal  0.105331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  22.73 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  26.95 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.8 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  28.67 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  22.73 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  22.59 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  29.51 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  30.3 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  26.76 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  25.77 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  25.77 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  29.55 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  26.15 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  32.64 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  21.9 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.57 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  30.49 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  24.92 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.07 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  25.31 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  25.68 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  28.79 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  25.64 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  25.97 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  21.48 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  26.47 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.43 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  30.36 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  26.07 
 
 		 456 aa  62.8  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  32.78 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.97 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  28.64 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  27.41 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  27.02 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.71 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  24.75 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.95 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  29.82 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  25.96 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  21.92 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  27.81 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  24.7 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  22.32 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4219  beta-lactamase  26.57 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  21.87 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  25.93 
 
 		 717 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  22.03 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.34 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  21.74 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  22.7 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.22 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  27.23 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  27.66 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  29.48 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  24.28 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  27.66 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  22.78 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.32 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  20.93 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  25.1 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1527  beta-lactamase  28.8 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.129016  normal  0.599812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.59 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  24.56 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.12 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  24.6 
 
 		 582 aa  56.6  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  27.49 
 
 		 359 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  20.59 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  20.59 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  26.37 
 
 		 711 aa  56.2  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  25.67 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  28 
 
 		 784 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  26.62 
 
 		 475 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  26.09 
 
 		 473 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  23.51 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  22.19 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  27.61 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  24 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  26.77 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  24.75 
 
 		 497 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2416  beta-lactamase  26.14 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.62 
 
 		 468 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  29.35 
 
 		 517 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  24.64 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>