253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3093 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  100 
 
 
333 aa  696    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  46.6 
 
 
463 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  43.21 
 
 
340 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  43.51 
 
 
335 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  27.27 
 
 
530 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  25.93 
 
 
505 aa  99.4  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  28.95 
 
 
378 aa  95.9  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.61 
 
 
640 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  28.89 
 
 
530 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  28.52 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  27.46 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  25.85 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  27.34 
 
 
309 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  27.34 
 
 
309 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  28.21 
 
 
486 aa  86.3  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  31.58 
 
 
380 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.59 
 
 
389 aa  86.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  31.58 
 
 
380 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.73 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.16 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.76 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  26.52 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  27.97 
 
 
524 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  26.85 
 
 
305 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  27.24 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  25 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  25.09 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  26.83 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.79 
 
 
419 aa  82.8  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  24.74 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  25.18 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.07 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.83 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.74 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  25.55 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  25 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  24.83 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  24.74 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  26.48 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  24.74 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  31.36 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  25.17 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.93 
 
 
425 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  25.25 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  27.87 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2416  beta-lactamase  26.21 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197066  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.23 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6382  beta-lactamase  23.42 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  26.04 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.23 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.23 
 
 
419 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.9 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.23 
 
 
419 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  23.55 
 
 
598 aa  75.9  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  25.16 
 
 
475 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.72 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.82 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  30.23 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  24.93 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.49 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  28.97 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  25.91 
 
 
522 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  26.52 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.81 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.83 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  27.12 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  26.04 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  26.04 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  23.24 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  22.46 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  23.23 
 
 
476 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  25.89 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.82 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  29.07 
 
 
483 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  25.57 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  25.79 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  25.57 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  30.51 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  26.32 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  26.32 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  24.6 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  25.41 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  25.36 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  23.42 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1161  beta-lactamase  26.09 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.580362  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  23.77 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  24.73 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  25.81 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  25.27 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.36 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  26.56 
 
 
491 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  26.82 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  25.08 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  23.45 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.37 
 
 
420 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  25.08 
 
 
503 aa  65.9  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  29.89 
 
 
504 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  27.76 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.83 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  23.89 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>