271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2902 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  100 
 
 		 413 aa  855    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  40.18 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  37.89 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  38.38 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  37.68 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  35.4 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  34.27 
 
 		 505 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  33.7 
 
 		 447 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  33.7 
 
 		 447 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  33.53 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  34.25 
 
 		 447 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.12 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  35.69 
 
 		 412 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.33 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  32.85 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  31.05 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.01 
 
 		 419 aa  176  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  34.63 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  34.71 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.54 
 
 		 449 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  30.61 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  35.9 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.04 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  29.74 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  30.32 
 
 		 384 aa  142  8e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.77 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.49 
 
 		 467 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.97 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  29.19 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  27.47 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.86 
 
 		 452 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  29.17 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  26.87 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.45 
 
 		 395 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.68 
 
 		 408 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.18 
 
 		 448 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.98 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.24 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.33 
 
 		 449 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  30.31 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.9 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.15 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  30.67 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  30 
 
 		 315 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  29.68 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  30.6 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.85 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  29.97 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  30.04 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.11 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  24.91 
 
 		 387 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  29.33 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  30.82 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  27.55 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.62 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  28.28 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  28.32 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.42 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.42 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.95 
 
 		 598 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  28.57 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.09 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  26.69 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  26.69 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  27.27 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.94 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  27.93 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  27.93 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.02 
 
 		 384 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  27.82 
 
 		 466 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  27.76 
 
 		 443 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  26.74 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  26.28 
 
 		 530 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  27.92 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  28.98 
 
 		 314 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  27.17 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.96 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.14 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  27.87 
 
 		 305 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  27.11 
 
 		 467 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  26.15 
 
 		 481 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  27.89 
 
 		 456 aa  96.3  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  24.67 
 
 		 432 aa  96.3  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  27.93 
 
 		 305 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  26.67 
 
 		 371 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.52 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  27.53 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.86 
 
 		 640 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  28.42 
 
 		 305 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  27.39 
 
 		 328 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  27.53 
 
 		 309 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.18 
 
 		 305 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  26.83 
 
 		 305 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  29.08 
 
 		 459 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  27.53 
 
 		 309 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  28.47 
 
 		 491 aa  93.2  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.58 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.33 
 
 		 439 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  27.91 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.07 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>