267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11737 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  100 
 
 
415 aa  843    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  62.08 
 
 
385 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  62.08 
 
 
385 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  61.82 
 
 
385 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.83 
 
 
397 aa  346  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  47.4 
 
 
395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.74 
 
 
443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.17 
 
 
467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.89 
 
 
467 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.68 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  35.88 
 
 
397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.51 
 
 
452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.98 
 
 
445 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.11 
 
 
442 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.48 
 
 
430 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  32.54 
 
 
389 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.36 
 
 
442 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.52 
 
 
408 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.33 
 
 
391 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.64 
 
 
439 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.49 
 
 
448 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.92 
 
 
410 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.43 
 
 
449 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.67 
 
 
446 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.42 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  31.97 
 
 
405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.73 
 
 
446 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.67 
 
 
449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.38 
 
 
419 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.15 
 
 
387 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.38 
 
 
419 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.13 
 
 
419 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.38 
 
 
419 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.13 
 
 
419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.25 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.55 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.2 
 
 
419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.13 
 
 
419 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  31.28 
 
 
390 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.79 
 
 
419 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.36 
 
 
419 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  26.74 
 
 
395 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  30.75 
 
 
414 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  30.45 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.48 
 
 
415 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  27.52 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  24.19 
 
 
431 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.36 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  32.22 
 
 
410 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.48 
 
 
420 aa  126  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  29.33 
 
 
505 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  26.92 
 
 
421 aa  123  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  27.96 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.7 
 
 
450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.01 
 
 
439 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  30.18 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  30.97 
 
 
389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  26.5 
 
 
446 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  27.08 
 
 
450 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.02 
 
 
452 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  27.91 
 
 
416 aa  112  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  29.36 
 
 
405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.09 
 
 
449 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.61 
 
 
444 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  29.53 
 
 
417 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.3 
 
 
430 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.74 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  31.05 
 
 
396 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  27.87 
 
 
404 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  24.7 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  28.79 
 
 
447 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  28.79 
 
 
447 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  28.79 
 
 
447 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  24.08 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  27.34 
 
 
384 aa  84  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.75 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  28.57 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.15 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  29.85 
 
 
524 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  26.47 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  26.38 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  26.94 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  25.51 
 
 
315 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  25.51 
 
 
315 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  26.15 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  27.35 
 
 
315 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  26.94 
 
 
315 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  28.05 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  25.51 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  28.05 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  25.82 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  24.58 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.94 
 
 
315 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  26.63 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  27.74 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  33.33 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  26.81 
 
 
473 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  30.9 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  26.81 
 
 
473 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>