112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03702 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03702  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  279  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.255314  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  79.85 
 
 		 380 aa  225  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  79.85 
 
 		 380 aa  225  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  40.74 
 
 		 374 aa  96.7  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  41.48 
 
 		 328 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  36.3 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  35.48 
 
 		 327 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  37.8 
 
 		 524 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  29.55 
 
 		 305 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  29.57 
 
 		 305 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.27 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  27.27 
 
 		 305 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.7 
 
 		 305 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  30.7 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  33.33 
 
 		 598 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  28.32 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  35.07 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  27.43 
 
 		 305 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  27.43 
 
 		 305 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  36.8 
 
 		 481 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  35.71 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  30.25 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  33.58 
 
 		 504 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  28.46 
 
 		 363 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  34.86 
 
 		 466 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  35.78 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  34.92 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  34.92 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  34.92 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  28.93 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  30.08 
 
 		 475 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  31.58 
 
 		 389 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  28.57 
 
 		 396 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  32.28 
 
 		 360 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  36.36 
 
 		 472 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.05 
 
 		 420 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  32.09 
 
 		 304 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  30 
 
 		 395 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  28.03 
 
 		 396 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  32.2 
 
 		 496 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.93 
 
 		 793 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  33.33 
 
 		 468 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  30.16 
 
 		 384 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4733  beta-lactamase  32.46 
 
 		 403 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  29.92 
 
 		 395 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  33.64 
 
 		 459 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  31.43 
 
 		 368 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  38.78 
 
 		 374 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  26.52 
 
 		 486 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  35.54 
 
 		 475 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  33.62 
 
 		 455 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  30.23 
 
 		 371 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  28.7 
 
 		 440 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  28.7 
 
 		 440 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  26.32 
 
 		 574 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  34.17 
 
 		 405 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.63 
 
 		 397 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  29.03 
 
 		 400 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  32.28 
 
 		 359 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  50 
 
 		 371 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.96 
 
 		 399 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  27.34 
 
 		 530 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  28.35 
 
 		 395 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  29.75 
 
 		 505 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  31.09 
 
 		 497 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.87 
 
 		 412 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  24.37 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  27.19 
 
 		 430 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2416  beta-lactamase  29.5 
 
 		 376 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.78 
 
 		 415 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  31.5 
 
 		 372 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  32.52 
 
 		 717 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  23.53 
 
 		 395 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  30.77 
 
 		 452 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  30.77 
 
 		 428 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  26.15 
 
 		 381 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  29.41 
 
 		 530 aa  43.5  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.6 
 
 		 389 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.95 
 
 		 468 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  28.33 
 
 		 405 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2315  beta-lactamase  28.04 
 
 		 440 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00477679  hitchhiker  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.74 
 
 		 476 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  30.43 
 
 		 566 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  25.96 
 
 		 382 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  31.91 
 
 		 404 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  32.5 
 
 		 784 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  25.98 
 
 		 381 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  30.21 
 
 		 478 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  30.69 
 
 		 337 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  31.78 
 
 		 432 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  29.81 
 
 		 491 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  27.97 
 
 		 390 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.88 
 
 		 508 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.45 
 
 		 446 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  31 
 
 		 358 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  30.53 
 
 		 364 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  24.64 
 
 		 422 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>