More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4733 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4733  beta-lactamase  100 
 
 		 403 aa  817    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3689  beta-lactamase  49.39 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10404  lipoprotein lpqK  52.75 
 
 		 409 aa  401  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2315  beta-lactamase  53.23 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00477679  hitchhiker  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3243  beta-lactamase  50.81 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3305  beta-lactamase  50.81 
 
 		 403 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0079678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3254  beta-lactamase  50.81 
 
 		 403 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3510  beta-lactamase  48.97 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2188  beta-lactamase  41 
 
 		 421 aa  255  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0459  beta-lactamase  38.66 
 
 		 415 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.45 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  26.54 
 
 		 713 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  27.73 
 
 		 416 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  29.22 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.98 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.34 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  27.25 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.51 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  31.73 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.9 
 
 		 429 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  30.58 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  27.67 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.19 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.19 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.18 
 
 		 470 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.96 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.96 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.75 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.19 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  26.2 
 
 		 720 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.14 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  26.48 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.56 
 
 		 413 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  27.54 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.54 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.54 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  31.6 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.53 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  27.13 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  25.34 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  25.34 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  25.11 
 
 		 385 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  24.7 
 
 		 388 aa  99.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.7 
 
 		 388 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  24.7 
 
 		 388 aa  99.8  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  24.7 
 
 		 388 aa  99.8  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1378  beta-lactamase  30.81 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  27.92 
 
 		 740 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.46 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  33.18 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  28.33 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.42 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.53 
 
 		 407 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  31.52 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.43 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  31.92 
 
 		 416 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  33.14 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.51 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.51 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  30.43 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  30 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.77 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.9 
 
 		 421 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  24.68 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  25.9 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.3 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  31.33 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.33 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  31.33 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  31.33 
 
 		 388 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.43 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.1 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.84 
 
 		 578 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  28.19 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25 
 
 		 487 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  30.67 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  30.67 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  34.12 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.11 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.09 
 
 		 477 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  29.33 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  31.79 
 
 		 593 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.44 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  22.3 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  25.52 
 
 		 431 aa  87.4  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  31.18 
 
 		 603 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  25.12 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.26 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  25.64 
 
 		 416 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  23.81 
 
 		 377 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  23.36 
 
 		 389 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  24.7 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  24.26 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  24.1 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  29.06 
 
 		 531 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  25.5 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  31.18 
 
 		 611 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  24.66 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>