163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1815 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1815  beta-lactamase  100 
 
 		 408 aa  848    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6382  beta-lactamase  67.91 
 
 		 472 aa  548  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2416  beta-lactamase  41.21 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0407  beta-lactamase  37.6 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488571  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1161  beta-lactamase  34.96 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.580362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  26.19 
 
 		 475 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  26.84 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  27.06 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.73 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  25.99 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.4 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  25.66 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  25.19 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  25.5 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  25.5 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.68 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  25.42 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  25.63 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.62 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  26.62 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.76 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.61 
 
 		 640 aa  69.7  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  24.91 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  23.35 
 
 		 598 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  26.98 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.32 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  25.22 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  24.16 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  22.16 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  21.47 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  21.73 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.9 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  21.73 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  24.58 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  21.71 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  25 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  22.74 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  21.41 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  20.83 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  27.39 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  25.08 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  23.42 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  24.52 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  33.05 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.09 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  32.2 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  22.81 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  23.85 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  26.45 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  25.31 
 
 		 530 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  24.92 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  24.41 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  28.51 
 
 		 459 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.24 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  24.14 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  23.17 
 
 		 483 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13543  putative hydrolase transmembrane protein  25.99 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  26.79 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  26.32 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  22.4 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  36.96 
 
 		 522 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  24.75 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  23.83 
 
 		 504 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  22.41 
 
 		 530 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  26.49 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  24.54 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  24.31 
 
 		 475 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  26.55 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.8 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  22.83 
 
 		 662 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  34.15 
 
 		 449 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2461  beta-lactamase  25.46 
 
 		 342 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00353647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  19.55 
 
 		 305 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  23.87 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  25.78 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2609  hypothetical protein  23.61 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  20.45 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  23.2 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  24.03 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.07 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.68 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  19.21 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  23.91 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  22.66 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.92 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  25.1 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  26.89 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.07 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.07 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  24.03 
 
 		 476 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2744  hypothetical protein  23.38 
 
 		 338 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000646489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2701  hypothetical protein  23.91 
 
 		 338 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  24.7 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  18.91 
 
 		 305 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  26.06 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  25.2 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  26.06 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.3 
 
 		 443 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  24.1 
 
 		 524 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  23.46 
 
 		 375 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>