79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0824 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0824  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1473  hypothetical protein  79 
 
 		 104 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1228  hypothetical protein  74.74 
 
 		 99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  70 
 
 		 103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  69.61 
 
 		 107 aa  143  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  67 
 
 		 103 aa  140  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  68.69 
 
 		 99 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  66 
 
 		 111 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  65 
 
 		 103 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  67.68 
 
 		 99 aa  136  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  65 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  65 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0887  hypothetical protein  65 
 
 		 103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1369  hypothetical protein  65 
 
 		 103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.775913  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  64 
 
 		 505 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  65 
 
 		 108 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1347  hypothetical protein  65 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0599686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  67 
 
 		 105 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4170  hypothetical protein  65.66 
 
 		 100 aa  130  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4092  hypothetical protein  63.64 
 
 		 104 aa  130  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6326  hypothetical protein  62.63 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.681991 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3736  hypothetical protein  60.78 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4813  hypothetical protein  60.78 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.927854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4148  hypothetical protein  56.44 
 
 		 103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  50.51 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  54.64 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0191  hypothetical protein  50.51 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134855  hitchhiker  0.000327701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17110  hypothetical protein  51.52 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118524  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  48.48 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  49.49 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2674  hypothetical protein  55.56 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.147046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  52.53 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  48.98 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1938  hypothetical protein  47.42 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000407914  normal  0.0922297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0714  hypothetical protein  42 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.74634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  45.45 
 
 		 590 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  47.47 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  43.3 
 
 		 608 aa  84  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  43.43 
 
 		 590 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18510  hypothetical protein  46.88 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3667  hypothetical protein  46.46 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.628036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  46.24 
 
 		 599 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  42.42 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  42.42 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3391  hypothetical protein  45.45 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  0.0862891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  43.43 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  44.33 
 
 		 616 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  36.36 
 
 		 603 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  44.09 
 
 		 627 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  38.83 
 
 		 596 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  36.89 
 
 		 598 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  36.89 
 
 		 612 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  40.91 
 
 		 571 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  38.46 
 
 		 619 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  38.37 
 
 		 580 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  35 
 
 		 600 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  33.33 
 
 		 587 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  35 
 
 		 600 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  32.67 
 
 		 607 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  37.37 
 
 		 578 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  34.44 
 
 		 574 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  34.44 
 
 		 574 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  34.44 
 
 		 574 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  33.7 
 
 		 562 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  31.68 
 
 		 587 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  31.63 
 
 		 562 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  34.34 
 
 		 570 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  35.05 
 
 		 560 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  32.32 
 
 		 578 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  34.09 
 
 		 596 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  32.95 
 
 		 581 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  31.45 
 
 		 654 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  30.43 
 
 		 588 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  27.84 
 
 		 561 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  29.35 
 
 		 596 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  30.28 
 
 		 575 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  30.28 
 
 		 575 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  30.28 
 
 		 575 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  28.24 
 
 		 594 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>