117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4431 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  71.35 
 
 
561 aa  764    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  69.41 
 
 
575 aa  759    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  63.13 
 
 
584 aa  663    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  69.41 
 
 
575 aa  759    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  68.75 
 
 
570 aa  758    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  61.02 
 
 
580 aa  645    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  69.23 
 
 
575 aa  758    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  67.2 
 
 
578 aa  730    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  63.17 
 
 
562 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  70 
 
 
560 aa  751    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  63.06 
 
 
562 aa  637    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  64.86 
 
 
587 aa  702    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  100 
 
 
581 aa  1159    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  61 
 
 
596 aa  624  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  58.62 
 
 
578 aa  611  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  58.52 
 
 
574 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  58.52 
 
 
574 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  58.52 
 
 
574 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  52.51 
 
 
587 aa  579  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  54.5 
 
 
594 aa  547  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  52.48 
 
 
619 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  50.43 
 
 
596 aa  525  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  47.46 
 
 
588 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  36.73 
 
 
590 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  35.75 
 
 
598 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  36.62 
 
 
608 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  34.28 
 
 
612 aa  290  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  35.28 
 
 
600 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  34.62 
 
 
600 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  31.89 
 
 
654 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  33.89 
 
 
596 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  36.5 
 
 
590 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  35.56 
 
 
616 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  34.16 
 
 
607 aa  260  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  32.1 
 
 
603 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  33.12 
 
 
599 aa  247  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  37.91 
 
 
446 aa  227  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  41.24 
 
 
445 aa  224  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  42.9 
 
 
450 aa  223  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  35.27 
 
 
587 aa  223  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  40.18 
 
 
445 aa  223  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  42.61 
 
 
450 aa  223  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  39.94 
 
 
446 aa  220  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  42.03 
 
 
450 aa  219  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  44.24 
 
 
453 aa  216  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  41.03 
 
 
452 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  42.18 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  37.29 
 
 
445 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  38.83 
 
 
451 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  38.83 
 
 
451 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  39.36 
 
 
627 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  40.59 
 
 
482 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  39.66 
 
 
451 aa  203  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  40.33 
 
 
453 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  41.28 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  39.88 
 
 
451 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  37.17 
 
 
445 aa  197  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  43.73 
 
 
466 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  39.78 
 
 
461 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  39.23 
 
 
452 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  36.97 
 
 
442 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  39.78 
 
 
461 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  39.78 
 
 
461 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  39.5 
 
 
452 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  38.39 
 
 
445 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  39.09 
 
 
444 aa  193  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  37.98 
 
 
444 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  36.69 
 
 
448 aa  191  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  37.24 
 
 
451 aa  190  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  38.65 
 
 
571 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  39.43 
 
 
473 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  35.81 
 
 
454 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  38.29 
 
 
453 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  36.09 
 
 
445 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  37.26 
 
 
445 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  35.71 
 
 
454 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  37.72 
 
 
445 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  38.94 
 
 
458 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  35.96 
 
 
441 aa  178  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  39.05 
 
 
443 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  38.6 
 
 
449 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  43.9 
 
 
123 aa  60.1  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  35.58 
 
 
120 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  35.58 
 
 
120 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  35.29 
 
 
122 aa  57.4  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0714  hypothetical protein  30.7 
 
 
123 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.74634  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  37.21 
 
 
111 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  38.64 
 
 
107 aa  54.7  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  36.05 
 
 
103 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  32.29 
 
 
114 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1473  hypothetical protein  34.04 
 
 
104 aa  51.6  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  34.15 
 
 
99 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  34.15 
 
 
99 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4092  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  50.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  32.69 
 
 
116 aa  50.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17110  hypothetical protein  36.05 
 
 
110 aa  50.8  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118524  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  31.68 
 
 
116 aa  50.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  32.56 
 
 
107 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  25.79 
 
 
452 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  31.25 
 
 
114 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>