118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0342 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  60 
 
 
574 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  60 
 
 
574 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1186    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  60 
 
 
574 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  59.49 
 
 
578 aa  671    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  52.51 
 
 
581 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  53.76 
 
 
594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  52.75 
 
 
570 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  52.62 
 
 
619 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  51.75 
 
 
575 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  51.75 
 
 
575 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  51.97 
 
 
596 aa  554  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  51.58 
 
 
575 aa  551  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  52.33 
 
 
560 aa  548  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  51.46 
 
 
561 aa  528  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  50.76 
 
 
562 aa  527  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  51.19 
 
 
578 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  49.66 
 
 
587 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  50.17 
 
 
562 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  49.15 
 
 
580 aa  497  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  48.67 
 
 
584 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  48.47 
 
 
588 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  46.67 
 
 
596 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  36.68 
 
 
590 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  35.48 
 
 
612 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  36.66 
 
 
616 aa  293  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  34.43 
 
 
600 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  32.38 
 
 
654 aa  290  6e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  34.53 
 
 
598 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  34.28 
 
 
600 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  33.39 
 
 
608 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  33.17 
 
 
603 aa  280  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  34.11 
 
 
596 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  35.8 
 
 
590 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  34 
 
 
599 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  32.52 
 
 
607 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  33.28 
 
 
627 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  36.46 
 
 
587 aa  230  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  35.57 
 
 
451 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  35.57 
 
 
451 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  36.96 
 
 
446 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  32.82 
 
 
571 aa  213  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  36.41 
 
 
446 aa  213  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  37.94 
 
 
445 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  36.39 
 
 
445 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  38.7 
 
 
450 aa  203  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  38.98 
 
 
450 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  36.68 
 
 
452 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  35.24 
 
 
444 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  36.78 
 
 
445 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  40.25 
 
 
453 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  38.2 
 
 
450 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  31.75 
 
 
452 aa  190  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  33.87 
 
 
454 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  38.7 
 
 
445 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  39.12 
 
 
453 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  37.5 
 
 
452 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  39.94 
 
 
453 aa  187  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  36.22 
 
 
445 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  36.88 
 
 
442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  36.6 
 
 
466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  35.63 
 
 
441 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  38.8 
 
 
444 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  35.03 
 
 
445 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  36.19 
 
 
482 aa  180  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  32.88 
 
 
448 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  35.56 
 
 
454 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  34.94 
 
 
445 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  31.57 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  38.39 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  38.39 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  38.39 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  34.77 
 
 
452 aa  173  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  37.77 
 
 
453 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  34.2 
 
 
451 aa  171  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  36.72 
 
 
458 aa  170  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  30.77 
 
 
451 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  32.69 
 
 
445 aa  167  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  37.78 
 
 
449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  36.31 
 
 
443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  37.2 
 
 
473 aa  163  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  39.58 
 
 
111 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  36.08 
 
 
103 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  35.24 
 
 
123 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  38.37 
 
 
105 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0191  hypothetical protein  33 
 
 
108 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134855  hitchhiker  0.000327701 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  31.13 
 
 
120 aa  53.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  32.26 
 
 
107 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  31.13 
 
 
120 aa  53.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0824  hypothetical protein  31.68 
 
 
103 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  32.26 
 
 
107 aa  51.6  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  31.68 
 
 
103 aa  50.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  30.34 
 
 
99 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1473  hypothetical protein  32.67 
 
 
104 aa  50.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0887  hypothetical protein  30.69 
 
 
103 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  31.68 
 
 
103 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1369  hypothetical protein  30.69 
 
 
103 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.775913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  30.68 
 
 
99 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>