117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1033 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  100 
 
 		 588 aa  1150    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  52.8 
 
 		 574 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  52.8 
 
 		 574 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  52.8 
 
 		 574 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  52.01 
 
 		 578 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  52.12 
 
 		 587 aa  532  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  50.08 
 
 		 596 aa  529  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  51.75 
 
 		 575 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  51.59 
 
 		 575 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  51.59 
 
 		 575 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  48.2 
 
 		 619 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  48.47 
 
 		 587 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  50.34 
 
 		 570 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  50.34 
 
 		 562 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  49.32 
 
 		 594 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  51.62 
 
 		 562 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  50.95 
 
 		 560 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  49.48 
 
 		 561 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  51.44 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  47.46 
 
 		 581 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  47.38 
 
 		 580 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  44.52 
 
 		 584 aa  442  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  48.3 
 
 		 596 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  35.99 
 
 		 590 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  35.26 
 
 		 596 aa  293  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  34.29 
 
 		 612 aa  289  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  34.48 
 
 		 600 aa  287  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  33.77 
 
 		 603 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  36.68 
 
 		 616 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  32.84 
 
 		 598 aa  279  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  34.65 
 
 		 600 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  34.86 
 
 		 608 aa  277  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  30.36 
 
 		 654 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  35.89 
 
 		 590 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  34.96 
 
 		 599 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  32.9 
 
 		 627 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  33.78 
 
 		 607 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  35.48 
 
 		 571 aa  244  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  34.94 
 
 		 587 aa  230  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  41.11 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  39.34 
 
 		 445 aa  219  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  38.97 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  41.18 
 
 		 445 aa  210  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  38.4 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  38.39 
 
 		 446 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  38.08 
 
 		 454 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  41.18 
 
 		 452 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  39.33 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  39.33 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  40.67 
 
 		 453 aa  200  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  37.15 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  39.88 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  40.74 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  37.84 
 
 		 445 aa  198  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  37.38 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  39.18 
 
 		 473 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  39.51 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  37.96 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  40.5 
 
 		 452 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  37.75 
 
 		 445 aa  193  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  39.63 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  35.6 
 
 		 448 aa  190  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  37.31 
 
 		 454 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  39.88 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  40.68 
 
 		 453 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  39.88 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  39.88 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  39.45 
 
 		 466 aa  187  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  39.35 
 
 		 442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  40.37 
 
 		 453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  36.61 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  38.32 
 
 		 451 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  39.22 
 
 		 458 aa  183  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  36.74 
 
 		 445 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  39.25 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  35.65 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  38.15 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  35.06 
 
 		 451 aa  167  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  38.89 
 
 		 449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  34.69 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  37.13 
 
 		 443 aa  160  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  33.01 
 
 		 114 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  34.65 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  36.73 
 
 		 107 aa  57  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  38.24 
 
 		 123 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  37.86 
 
 		 103 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  35.29 
 
 		 122 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  37.08 
 
 		 111 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  36.27 
 
 		 103 aa  54.3  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  34.74 
 
 		 103 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  35.92 
 
 		 103 aa  53.9  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  36.27 
 
 		 103 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  31.43 
 
 		 121 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1347  hypothetical protein  35.92 
 
 		 103 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0599686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0714  hypothetical protein  31.13 
 
 		 123 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.74634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  31.37 
 
 		 505 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0191  hypothetical protein  30.1 
 
 		 108 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134855  hitchhiker  0.000327701 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4813  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  50.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.927854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3736  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  50.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0887  hypothetical protein  33.98 
 
 		 103 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>