119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16490 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  64.22 
 
 		 587 aa  687    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  64.01 
 
 		 596 aa  635    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  69.7 
 
 		 575 aa  740    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  69.7 
 
 		 575 aa  740    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  69.7 
 
 		 570 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  69.7 
 
 		 575 aa  741    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  68.85 
 
 		 578 aa  731    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  64.49 
 
 		 562 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  69.41 
 
 		 560 aa  715    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  100 
 
 		 561 aa  1112    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  63.32 
 
 		 562 aa  637    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  71.35 
 
 		 581 aa  780    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  60.59 
 
 		 584 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  58.8 
 
 		 580 aa  605  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  58.42 
 
 		 574 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  58.42 
 
 		 574 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  58.42 
 
 		 574 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  56.1 
 
 		 578 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  53.57 
 
 		 619 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  51.45 
 
 		 587 aa  538  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  53.42 
 
 		 594 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  49.83 
 
 		 596 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  49.66 
 
 		 588 aa  484  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  36.77 
 
 		 600 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  36.82 
 
 		 612 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  36.17 
 
 		 600 aa  293  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  37.41 
 
 		 590 aa  293  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  35.51 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  35.49 
 
 		 608 aa  284  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  34.33 
 
 		 596 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  35.6 
 
 		 607 aa  276  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  31.23 
 
 		 654 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  37.21 
 
 		 590 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  33.99 
 
 		 599 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  34.78 
 
 		 616 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  33.16 
 
 		 627 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  33.16 
 
 		 571 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  41.54 
 
 		 603 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  39.08 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  41.38 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  41.88 
 
 		 450 aa  210  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  35.55 
 
 		 587 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  40.62 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  37.98 
 
 		 446 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  41.07 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  40.12 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  40.58 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  38.21 
 
 		 445 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  40.18 
 
 		 451 aa  203  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  40.18 
 
 		 451 aa  203  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  41.03 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  41.08 
 
 		 482 aa  200  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  42.51 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  39.18 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  42.51 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  41.19 
 
 		 453 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  41.1 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  42.22 
 
 		 452 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  41.1 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  40.9 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  38.82 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  37.72 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  37.5 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  40.95 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  40.6 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  40.6 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  40.6 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  34.6 
 
 		 445 aa  188  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  37.43 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  38.21 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  40.13 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  36.39 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  40.94 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  39.02 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  36.36 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  42.36 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  39.81 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  41.43 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  35.99 
 
 		 441 aa  171  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  35.83 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  39.22 
 
 		 449 aa  163  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  33.02 
 
 		 116 aa  57.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3391  hypothetical protein  36.19 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  0.0862891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  37.21 
 
 		 105 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  31.13 
 
 		 116 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  33.02 
 
 		 120 aa  56.2  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  34.04 
 
 		 111 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  33.02 
 
 		 120 aa  56.2  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0714  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.74634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  30.1 
 
 		 103 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  33.02 
 
 		 122 aa  53.9  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  32.26 
 
 		 114 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  32.04 
 
 		 108 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  31.18 
 
 		 114 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  32.69 
 
 		 123 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  31.07 
 
 		 107 aa  52.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0191  hypothetical protein  28.16 
 
 		 108 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134855  hitchhiker  0.000327701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  31.43 
 
 		 121 aa  51.6  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  31.37 
 
 		 505 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  30.85 
 
 		 107 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>