81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17100 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  883    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  50.9 
 
 
450 aa  382  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  50.9 
 
 
450 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  51.45 
 
 
450 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  50.57 
 
 
453 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  52.42 
 
 
473 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  52.81 
 
 
466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  52.32 
 
 
458 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  46.74 
 
 
454 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  45.03 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  47.37 
 
 
452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  47.88 
 
 
482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  44.08 
 
 
446 aa  336  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  47.89 
 
 
445 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  48.12 
 
 
451 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  47.66 
 
 
452 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  48.12 
 
 
451 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  42.98 
 
 
446 aa  329  6e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  47.03 
 
 
444 aa  329  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  48.12 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  48.44 
 
 
445 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  46.92 
 
 
445 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  45.1 
 
 
445 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  45.66 
 
 
441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  46.14 
 
 
444 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  47.26 
 
 
461 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  47.26 
 
 
461 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  47.26 
 
 
461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  47.54 
 
 
445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  42.45 
 
 
448 aa  312  9e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  45.92 
 
 
452 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  46.14 
 
 
452 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  46.7 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  47.38 
 
 
453 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  46.14 
 
 
453 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  41.65 
 
 
454 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  46.94 
 
 
453 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  39.91 
 
 
445 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  41.39 
 
 
451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  41.18 
 
 
451 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  41.39 
 
 
451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  44.07 
 
 
443 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  35.39 
 
 
598 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  33.12 
 
 
596 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  40.29 
 
 
607 aa  203  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  38.74 
 
 
600 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  36.95 
 
 
600 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  36.59 
 
 
612 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  34.06 
 
 
590 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  33.77 
 
 
608 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  36.42 
 
 
596 aa  189  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  40.63 
 
 
578 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  32.39 
 
 
627 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  33.26 
 
 
616 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  33.33 
 
 
599 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  33.33 
 
 
590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  38.39 
 
 
571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  41.95 
 
 
574 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  41.95 
 
 
574 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  41.95 
 
 
574 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  36.95 
 
 
570 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  38.84 
 
 
587 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  38.6 
 
 
584 aa  172  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  39.71 
 
 
619 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  40.39 
 
 
562 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  31.57 
 
 
603 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  38.6 
 
 
581 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  40 
 
 
575 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  40 
 
 
575 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  39.61 
 
 
575 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  37.78 
 
 
587 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  37.69 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  43.56 
 
 
596 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  40.07 
 
 
562 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  38.01 
 
 
588 aa  160  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  41.73 
 
 
580 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  38.49 
 
 
560 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  37.46 
 
 
594 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  37.43 
 
 
578 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  34.45 
 
 
587 aa  143  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
654 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>