127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2268 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  76.01 
 
 
596 aa  918    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  96.33 
 
 
600 aa  1155    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  64.86 
 
 
598 aa  775    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  80 
 
 
612 aa  959    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  100 
 
 
600 aa  1210    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  53.89 
 
 
590 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  52.07 
 
 
616 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  48.59 
 
 
603 aa  560  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  53.38 
 
 
590 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  48.26 
 
 
627 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  48.99 
 
 
599 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  47.66 
 
 
608 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  43.34 
 
 
607 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  46.9 
 
 
571 aa  478  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  37.23 
 
 
574 aa  318  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  37.23 
 
 
574 aa  318  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  37.23 
 
 
574 aa  318  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  35.69 
 
 
619 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  37.67 
 
 
596 aa  309  8e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  35.29 
 
 
587 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  36.76 
 
 
560 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  34.62 
 
 
570 aa  294  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  34.9 
 
 
562 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  36.01 
 
 
561 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  34.17 
 
 
578 aa  290  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  34.62 
 
 
581 aa  288  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  34.28 
 
 
587 aa  287  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  35.4 
 
 
562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  36.11 
 
 
580 aa  284  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  34.54 
 
 
575 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  34.65 
 
 
588 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  34.54 
 
 
575 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  34.54 
 
 
575 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  35.09 
 
 
594 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  32.9 
 
 
584 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  34.4 
 
 
578 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  38.65 
 
 
451 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  38.65 
 
 
451 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  41.49 
 
 
452 aa  250  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  42.56 
 
 
482 aa  248  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  37.77 
 
 
450 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  37.53 
 
 
445 aa  244  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  38.01 
 
 
450 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  40.2 
 
 
444 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  35.16 
 
 
448 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  36.87 
 
 
444 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  36.53 
 
 
454 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  33.5 
 
 
596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  37.92 
 
 
452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  33.77 
 
 
445 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  38.08 
 
 
445 aa  241  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  39.79 
 
 
445 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  38.04 
 
 
451 aa  240  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  34.23 
 
 
446 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  37.08 
 
 
451 aa  238  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  34.6 
 
 
446 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  36.67 
 
 
450 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  37.83 
 
 
451 aa  233  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  39.32 
 
 
445 aa  233  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  38.88 
 
 
453 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  36.47 
 
 
445 aa  232  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  36.04 
 
 
452 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  41.76 
 
 
453 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  35.84 
 
 
445 aa  226  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  40.69 
 
 
452 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  34.7 
 
 
473 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  40.15 
 
 
461 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  40.15 
 
 
461 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  40.69 
 
 
461 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  32.97 
 
 
454 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  38.05 
 
 
453 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  39.05 
 
 
445 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  38.71 
 
 
442 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  41.23 
 
 
458 aa  217  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  39.4 
 
 
453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  36.99 
 
 
466 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  34.63 
 
 
441 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  35.15 
 
 
443 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  40.84 
 
 
449 aa  204  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
654 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  31.65 
 
 
587 aa  160  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  45.3 
 
 
116 aa  81.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  42.48 
 
 
116 aa  77  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  40.71 
 
 
123 aa  72  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3391  hypothetical protein  41.59 
 
 
130 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  0.0862891 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  34.21 
 
 
114 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  36.44 
 
 
120 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  36.44 
 
 
120 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  38.89 
 
 
122 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  38.83 
 
 
103 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  38.83 
 
 
103 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  38.1 
 
 
103 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  34.86 
 
 
505 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  66.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  37 
 
 
99 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  39.42 
 
 
108 aa  65.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1347  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0599686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  40.78 
 
 
103 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  33.93 
 
 
114 aa  65.1  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>