89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2673 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  909    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  62.67 
 
 		 445 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  61.09 
 
 		 452 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  60.22 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  61.33 
 
 		 444 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  56.76 
 
 		 446 aa  524  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  59.37 
 
 		 452 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  60.49 
 
 		 451 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  60.49 
 
 		 451 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  59.33 
 
 		 445 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  56.76 
 
 		 446 aa  521  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  60.13 
 
 		 445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  61.4 
 
 		 461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  61.4 
 
 		 461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  59.96 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  61.63 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  61.63 
 
 		 453 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  56.22 
 
 		 448 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  61.85 
 
 		 453 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  60.75 
 
 		 445 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  58.22 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  60.27 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  60.27 
 
 		 452 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  54.42 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  53.12 
 
 		 441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  50.66 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  49.78 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  46.36 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  47.45 
 
 		 451 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  45.92 
 
 		 451 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  47.77 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  47.54 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  46.56 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  48.55 
 
 		 450 aa  372  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  47.57 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  49.77 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  45.89 
 
 		 458 aa  339  8e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  46.05 
 
 		 453 aa  339  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  45.47 
 
 		 473 aa  337  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  44.35 
 
 		 482 aa  335  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  46.71 
 
 		 466 aa  319  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  41.65 
 
 		 449 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  34.5 
 
 		 596 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  38.64 
 
 		 590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  33.19 
 
 		 600 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  33.04 
 
 		 598 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  34.62 
 
 		 616 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  32.53 
 
 		 612 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  32.97 
 
 		 600 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  39.32 
 
 		 590 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  33.55 
 
 		 608 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  34.47 
 
 		 607 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  33.69 
 
 		 627 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  34.1 
 
 		 603 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  33.19 
 
 		 599 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  37.12 
 
 		 596 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  39.38 
 
 		 562 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  36.29 
 
 		 619 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  33.26 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  35.71 
 
 		 581 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  38.81 
 
 		 587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  38.15 
 
 		 570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  34.69 
 
 		 578 aa  183  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  38.51 
 
 		 575 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  38.51 
 
 		 575 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  38.51 
 
 		 575 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  37.31 
 
 		 588 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  35.56 
 
 		 587 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  37.5 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  36.92 
 
 		 574 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  36.92 
 
 		 574 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  39.45 
 
 		 562 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  36.92 
 
 		 574 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  36.42 
 
 		 584 aa  170  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  35.83 
 
 		 561 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  35.66 
 
 		 596 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  36.39 
 
 		 578 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  32.35 
 
 		 594 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  33.43 
 
 		 580 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  30.24 
 
 		 654 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  32.25 
 
 		 587 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  29.27 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  28.38 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  25.85 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  30.77 
 
 		 452 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  26.86 
 
 		 452 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  25.44 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  27.45 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  25.09 
 
 		 456 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.719749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>