69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0985 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  923    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  45.86 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  44.22 
 
 
456 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  43.99 
 
 
456 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  43.86 
 
 
455 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  43.33 
 
 
452 aa  378  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  37.64 
 
 
445 aa  347  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  39.69 
 
 
452 aa  333  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  38.98 
 
 
452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  35.53 
 
 
464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  32.46 
 
 
469 aa  275  8e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  33.86 
 
 
464 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  33.18 
 
 
484 aa  242  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  32.67 
 
 
451 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  28.51 
 
 
607 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  32.08 
 
 
443 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  27.78 
 
 
596 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  28.32 
 
 
453 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  32.68 
 
 
608 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  27.75 
 
 
461 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  27.75 
 
 
452 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  28 
 
 
454 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  27.75 
 
 
453 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  27.75 
 
 
461 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  27.75 
 
 
461 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  27.46 
 
 
612 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  27.33 
 
 
627 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  26.21 
 
 
571 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  27.93 
 
 
453 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  28.22 
 
 
451 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  28.45 
 
 
590 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  25.58 
 
 
444 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  26.64 
 
 
598 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  24.68 
 
 
452 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  25.98 
 
 
603 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  28 
 
 
590 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  26.26 
 
 
600 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  25.97 
 
 
599 aa  53.9  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  27.03 
 
 
616 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  25.97 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  27.62 
 
 
450 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  28.14 
 
 
619 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  28.9 
 
 
445 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  26.58 
 
 
600 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  26.14 
 
 
445 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  29.13 
 
 
562 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  22.14 
 
 
570 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  28.31 
 
 
441 aa  50.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  25.75 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  25.79 
 
 
581 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  27.1 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  25 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  27.11 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  29.89 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  25.9 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  25.23 
 
 
482 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  28 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  24.23 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  26.59 
 
 
452 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  26.86 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  26.67 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  23.53 
 
 
445 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  25.12 
 
 
575 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  25.12 
 
 
575 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  25.49 
 
 
561 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  25.12 
 
 
575 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  25.56 
 
 
473 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  25.57 
 
 
445 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  24.74 
 
 
596 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>