121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2826 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  59.79 
 
 
570 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  62.35 
 
 
578 aa  646    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  100 
 
 
580 aa  1153    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  61.02 
 
 
581 aa  653    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  59.45 
 
 
575 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  59.45 
 
 
575 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  59.27 
 
 
575 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  60.82 
 
 
560 aa  618  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  57.44 
 
 
587 aa  612  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  58.48 
 
 
561 aa  611  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  58.98 
 
 
562 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  57.85 
 
 
562 aa  559  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  52.36 
 
 
584 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  56.14 
 
 
596 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  50.43 
 
 
578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  50.96 
 
 
574 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  50.96 
 
 
574 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  49.15 
 
 
587 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  50.96 
 
 
574 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  49.16 
 
 
594 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  45.35 
 
 
596 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  46.54 
 
 
619 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  47.38 
 
 
588 aa  451  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  33.98 
 
 
654 aa  299  9e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  36.6 
 
 
600 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  36.39 
 
 
608 aa  298  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  34.7 
 
 
598 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  36.11 
 
 
600 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  35.06 
 
 
596 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  35.93 
 
 
612 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  34.51 
 
 
590 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  34.4 
 
 
590 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  34.8 
 
 
607 aa  262  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  35.16 
 
 
599 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  34.04 
 
 
616 aa  260  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  32.4 
 
 
603 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  35.36 
 
 
571 aa  243  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  37.5 
 
 
587 aa  233  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  38.51 
 
 
627 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  37.47 
 
 
450 aa  190  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  34.47 
 
 
445 aa  187  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  37.19 
 
 
450 aa  186  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  37.32 
 
 
452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  39.09 
 
 
452 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  33.58 
 
 
446 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  39.27 
 
 
453 aa  180  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  37.77 
 
 
445 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  39.09 
 
 
461 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  39.09 
 
 
461 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  39.09 
 
 
461 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  36.42 
 
 
446 aa  179  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  38.97 
 
 
453 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  36.96 
 
 
445 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  38.46 
 
 
452 aa  176  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  37.04 
 
 
444 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  34.33 
 
 
454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  36.31 
 
 
450 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  37.85 
 
 
453 aa  170  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  33.33 
 
 
451 aa  170  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  37.01 
 
 
482 aa  170  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  38.05 
 
 
458 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  33.24 
 
 
445 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  33.13 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  36.67 
 
 
473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  32.85 
 
 
451 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  35.51 
 
 
453 aa  165  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  41.84 
 
 
449 aa  164  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  36.73 
 
 
452 aa  163  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  35.45 
 
 
451 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  34.95 
 
 
445 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  35.45 
 
 
451 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  35.92 
 
 
445 aa  161  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  34.68 
 
 
442 aa  158  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  36.08 
 
 
444 aa  156  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  35.91 
 
 
445 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  33.43 
 
 
454 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  38.32 
 
 
466 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  32.18 
 
 
451 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  34.01 
 
 
445 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  37.42 
 
 
443 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  33.02 
 
 
441 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  38.95 
 
 
107 aa  67.4  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0714  hypothetical protein  34.86 
 
 
123 aa  62  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.74634  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0191  hypothetical protein  36.89 
 
 
108 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134855  hitchhiker  0.000327701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  37.62 
 
 
114 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  36.28 
 
 
114 aa  61.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  37.74 
 
 
505 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  32.43 
 
 
122 aa  58.9  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  39.53 
 
 
103 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  38.95 
 
 
103 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4092  hypothetical protein  37.5 
 
 
104 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0824  hypothetical protein  38.37 
 
 
103 aa  57.4  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  31.19 
 
 
121 aa  57  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  38.46 
 
 
123 aa  57  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  37.89 
 
 
103 aa  57  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3391  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  0.0862891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  34.23 
 
 
120 aa  57  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  36.17 
 
 
107 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  34.23 
 
 
120 aa  57  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0887  hypothetical protein  38.37 
 
 
103 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>