126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2416 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  67.61 
 
 
599 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  67.49 
 
 
627 aa  706    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  100 
 
 
571 aa  1157    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  53.2 
 
 
608 aa  541  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  46.8 
 
 
598 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  47.93 
 
 
590 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  51.03 
 
 
616 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  47.57 
 
 
590 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  45.81 
 
 
600 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  46.9 
 
 
600 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  44.11 
 
 
596 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  45.42 
 
 
612 aa  458  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  42.96 
 
 
603 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  44.58 
 
 
607 aa  445  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  34.63 
 
 
596 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  34.42 
 
 
587 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  35.48 
 
 
588 aa  244  3e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  35.36 
 
 
580 aa  243  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  35.45 
 
 
574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  35.45 
 
 
574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  35.45 
 
 
574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  33.1 
 
 
578 aa  233  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  34.54 
 
 
560 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  35.63 
 
 
454 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  38.05 
 
 
451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  38.05 
 
 
451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  36.85 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  32.87 
 
 
570 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  34.67 
 
 
562 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  36.52 
 
 
482 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  36.62 
 
 
450 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  37.74 
 
 
444 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  37.05 
 
 
473 aa  217  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  32.82 
 
 
587 aa  216  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  36.45 
 
 
450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  36.43 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  32.63 
 
 
584 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  32.87 
 
 
578 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  33.5 
 
 
575 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  33.51 
 
 
594 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  34.45 
 
 
596 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  34.6 
 
 
445 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  33.33 
 
 
575 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  33.33 
 
 
575 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  35.73 
 
 
458 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  42.11 
 
 
562 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  38.73 
 
 
444 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  39.76 
 
 
619 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  35.98 
 
 
445 aa  204  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  42.81 
 
 
445 aa  200  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  35.03 
 
 
453 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  40.41 
 
 
445 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  32.58 
 
 
448 aa  198  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  34.7 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  39.1 
 
 
452 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  40.39 
 
 
561 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  34.39 
 
 
445 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  35.6 
 
 
453 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  34.43 
 
 
446 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  35.62 
 
 
442 aa  194  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  40.74 
 
 
445 aa  193  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  33.26 
 
 
454 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  34.74 
 
 
453 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  38.65 
 
 
581 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  35.06 
 
 
441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  37.83 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  31.46 
 
 
445 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  35.36 
 
 
452 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  35.6 
 
 
453 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  34.21 
 
 
452 aa  187  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  34.98 
 
 
461 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  34.98 
 
 
461 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  34.42 
 
 
466 aa  183  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  40.79 
 
 
449 aa  183  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  34.74 
 
 
461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  31.43 
 
 
451 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  31.91 
 
 
451 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  31.91 
 
 
451 aa  171  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  32.64 
 
 
443 aa  160  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  31.92 
 
 
587 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  25.58 
 
 
654 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  46.67 
 
 
107 aa  84.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1473  hypothetical protein  47.73 
 
 
104 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  48.91 
 
 
123 aa  80.9  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  49.4 
 
 
103 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  50.62 
 
 
103 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  49.38 
 
 
103 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  48.15 
 
 
103 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  39.22 
 
 
116 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1347  hypothetical protein  45.68 
 
 
103 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0599686 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  39.22 
 
 
116 aa  71.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4170  hypothetical protein  46.15 
 
 
100 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1228  hypothetical protein  38.82 
 
 
99 aa  69.3  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  41.03 
 
 
99 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  41.03 
 
 
99 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  46.91 
 
 
105 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  42.39 
 
 
114 aa  67.4  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0887  hypothetical protein  40.91 
 
 
103 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1369  hypothetical protein  40.91 
 
 
103 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.775913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0824  hypothetical protein  40.91 
 
 
103 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.299347 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>