78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4626 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  235  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  93.91 
 
 
116 aa  221  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  63.72 
 
 
123 aa  145  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  53.4 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  51.52 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  51.52 
 
 
99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  50.51 
 
 
99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  52.43 
 
 
111 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  47.27 
 
 
505 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1473  hypothetical protein  51.49 
 
 
104 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4092  hypothetical protein  48.04 
 
 
104 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  49.02 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  49.02 
 
 
103 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  53.47 
 
 
105 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1228  hypothetical protein  49.49 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4170  hypothetical protein  51.02 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6326  hypothetical protein  47.06 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.681991 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0887  hypothetical protein  49 
 
 
103 aa  97.1  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0824  hypothetical protein  49.49 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1369  hypothetical protein  49 
 
 
103 aa  97.1  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.775913  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  48 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  48 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  48.54 
 
 
590 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1347  hypothetical protein  48 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0599686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  45.61 
 
 
608 aa  94  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0714  hypothetical protein  42.2 
 
 
123 aa  94  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.74634  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4813  hypothetical protein  48 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.927854  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  43.69 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3736  hypothetical protein  48 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  47.57 
 
 
590 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4148  hypothetical protein  42.16 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  44.55 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  39.13 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  42.99 
 
 
120 aa  89.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  42.99 
 
 
120 aa  89.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  43.81 
 
 
599 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  39.47 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3391  hypothetical protein  42.98 
 
 
130 aa  87  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  0.0862891 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  44 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  44.55 
 
 
598 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  44 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0191  hypothetical protein  44.55 
 
 
108 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134855  hitchhiker  0.000327701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  44.74 
 
 
612 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  43.69 
 
 
616 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  42.16 
 
 
627 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1938  hypothetical protein  43.69 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000407914  normal  0.0922297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  43.36 
 
 
600 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  42.2 
 
 
596 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3667  hypothetical protein  43.14 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.628036  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  41.18 
 
 
603 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  42.48 
 
 
600 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2674  hypothetical protein  44.94 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.147046  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17110  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  39.22 
 
 
571 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  34.23 
 
 
607 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  33.02 
 
 
578 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  34.91 
 
 
560 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18510  hypothetical protein  36.63 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  33.33 
 
 
570 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  32.38 
 
 
596 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  32.71 
 
 
580 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  31.13 
 
 
561 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  31.78 
 
 
619 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  30.39 
 
 
587 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  30.69 
 
 
594 aa  50.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  35.29 
 
 
588 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  32.41 
 
 
562 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  31.68 
 
 
581 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  30.51 
 
 
575 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  30.51 
 
 
575 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  30.51 
 
 
575 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  29.52 
 
 
587 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  30.56 
 
 
578 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  30.93 
 
 
562 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  29.13 
 
 
596 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  29.52 
 
 
574 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  29.52 
 
 
574 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  29.52 
 
 
574 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>