130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0040 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  100 
 
 		 616 aa  1233    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  68.8 
 
 		 590 aa  790    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  68.14 
 
 		 590 aa  759    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  52.61 
 
 		 608 aa  609  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  53.29 
 
 		 596 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  50.75 
 
 		 598 aa  585  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  53.34 
 
 		 612 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  52.01 
 
 		 599 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  49.83 
 
 		 603 aa  568  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  51.74 
 
 		 600 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  52.23 
 
 		 600 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  50.42 
 
 		 627 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  45.77 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  50.84 
 
 		 571 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  37.21 
 
 		 619 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  37.87 
 
 		 587 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  35.12 
 
 		 596 aa  306  6e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  36.66 
 
 		 587 aa  301  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  36.26 
 
 		 570 aa  296  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  36.53 
 
 		 588 aa  279  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  36.17 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  36.17 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  36.17 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  35.56 
 
 		 581 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  35.34 
 
 		 575 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  35.34 
 
 		 575 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  35.34 
 
 		 575 aa  265  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  35.74 
 
 		 578 aa  263  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  34.78 
 
 		 560 aa  263  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  35.07 
 
 		 562 aa  262  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  39.55 
 
 		 454 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  34.31 
 
 		 580 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  33.71 
 
 		 584 aa  253  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  43.73 
 
 		 452 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  38.07 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  38.07 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  33.99 
 
 		 594 aa  250  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  34.11 
 
 		 578 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  36.3 
 
 		 445 aa  246  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  41.49 
 
 		 444 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  35.29 
 
 		 596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  38.89 
 
 		 450 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  38.43 
 
 		 450 aa  242  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  38.84 
 
 		 453 aa  242  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  38.73 
 
 		 441 aa  242  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  40.47 
 
 		 453 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  39.11 
 
 		 444 aa  240  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  45.03 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  41.1 
 
 		 453 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  41.92 
 
 		 562 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  39.68 
 
 		 461 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  39.68 
 
 		 461 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  40.85 
 
 		 452 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  39.71 
 
 		 446 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  35.68 
 
 		 446 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  37.24 
 
 		 450 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  40.5 
 
 		 461 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  41.98 
 
 		 451 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  35.38 
 
 		 442 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  36.23 
 
 		 473 aa  233  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  36.42 
 
 		 458 aa  232  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  40.96 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  38.08 
 
 		 452 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  38.58 
 
 		 452 aa  232  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  39.63 
 
 		 445 aa  230  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  40.97 
 
 		 445 aa  229  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  34.63 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  34.62 
 
 		 454 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  42.32 
 
 		 561 aa  228  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  35.9 
 
 		 445 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  33.85 
 
 		 445 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  34.62 
 
 		 451 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  38.68 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  35.98 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  36.47 
 
 		 451 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  34.11 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  34.57 
 
 		 466 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  33.41 
 
 		 449 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 		 654 aa  163  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  30.84 
 
 		 587 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  49.49 
 
 		 103 aa  89.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  48.28 
 
 		 120 aa  88.6  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  48.28 
 
 		 120 aa  88.6  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  45.54 
 
 		 122 aa  88.2  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  47.47 
 
 		 107 aa  88.2  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1473  hypothetical protein  45.45 
 
 		 104 aa  87.4  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  49.48 
 
 		 103 aa  87.4  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  49.48 
 
 		 103 aa  87  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  49.48 
 
 		 103 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  45.54 
 
 		 123 aa  85.1  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1347  hypothetical protein  49.48 
 
 		 103 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0599686 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  43.69 
 
 		 116 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  45.45 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3391  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  0.0862891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  47.87 
 
 		 103 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  53.01 
 
 		 105 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  43.69 
 
 		 116 aa  82  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  43.3 
 
 		 99 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  48.94 
 
 		 111 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.98227 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>