129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4459 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1213    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  78.32 
 
 		 627 aa  922    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  67.61 
 
 		 571 aa  694    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  55.74 
 
 		 608 aa  633  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  52.14 
 
 		 590 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  49.41 
 
 		 598 aa  559  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  51.85 
 
 		 616 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  52.38 
 
 		 590 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  48.09 
 
 		 596 aa  544  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  49.17 
 
 		 612 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  49.33 
 
 		 600 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  48.99 
 
 		 600 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  45.26 
 
 		 603 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  47.56 
 
 		 607 aa  492  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  34.92 
 
 		 596 aa  287  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  36.14 
 
 		 587 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  35.86 
 
 		 578 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  36.3 
 
 		 574 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  36.3 
 
 		 574 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  36.3 
 
 		 574 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  34 
 
 		 587 aa  267  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  33.96 
 
 		 619 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  35.26 
 
 		 588 aa  261  4e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  35.33 
 
 		 562 aa  259  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  35.16 
 
 		 580 aa  258  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  33.94 
 
 		 560 aa  249  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  33.12 
 
 		 581 aa  247  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  35.21 
 
 		 578 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  33.61 
 
 		 562 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  33.22 
 
 		 570 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  33.39 
 
 		 561 aa  242  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  34.6 
 
 		 575 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  34.6 
 
 		 575 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  34.6 
 
 		 575 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  35.16 
 
 		 451 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  35.16 
 
 		 451 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  36.29 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  32.62 
 
 		 584 aa  229  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  33.55 
 
 		 594 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  35.96 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  35.7 
 
 		 446 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  33.89 
 
 		 596 aa  223  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  34.94 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  36.12 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  39.48 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  35.25 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  33.59 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  34 
 
 		 454 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  33.19 
 
 		 454 aa  210  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  35.02 
 
 		 450 aa  210  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  36.71 
 
 		 445 aa  210  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  35.24 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  34.8 
 
 		 450 aa  207  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  34.42 
 
 		 453 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  33.26 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  33.76 
 
 		 452 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  35.53 
 
 		 473 aa  203  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  34.95 
 
 		 461 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  34.95 
 
 		 461 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  33.85 
 
 		 445 aa  203  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  39.25 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  33.49 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  35.24 
 
 		 453 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  34.53 
 
 		 441 aa  200  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  34.95 
 
 		 461 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  30.11 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  34.08 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  35.16 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  31.79 
 
 		 451 aa  193  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  33.33 
 
 		 445 aa  193  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  33.85 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  31.79 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  31.95 
 
 		 451 aa  190  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  32.37 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  33.12 
 
 		 453 aa  187  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  34.23 
 
 		 442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  38.64 
 
 		 449 aa  179  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  33.77 
 
 		 443 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 		 654 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  27.4 
 
 		 587 aa  135  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  46.67 
 
 		 116 aa  93.6  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  46.6 
 
 		 123 aa  93.6  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1473  hypothetical protein  49.04 
 
 		 104 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  49.47 
 
 		 107 aa  91.3  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  46.81 
 
 		 99 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  43.81 
 
 		 116 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3736  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  45.74 
 
 		 99 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4813  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.927854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  44.9 
 
 		 108 aa  88.2  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  43.4 
 
 		 122 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  45.54 
 
 		 103 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  45.54 
 
 		 103 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  84.3  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1938  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000407914  normal  0.0922297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  46 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  42.2 
 
 		 121 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  47 
 
 		 103 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  45 
 
 		 103 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>