78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4092 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4092  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6326  hypothetical protein  79.41 
 
 		 102 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.681991 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  75.49 
 
 		 103 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  72.82 
 
 		 103 aa  151  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  70.59 
 
 		 505 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  71.84 
 
 		 103 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  70.59 
 
 		 103 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1347  hypothetical protein  71.57 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0599686 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1369  hypothetical protein  70.59 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.775913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0887  hypothetical protein  70.59 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  68.27 
 
 		 107 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  68.69 
 
 		 99 aa  143  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  70.71 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1228  hypothetical protein  68.69 
 
 		 99 aa  140  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  66.67 
 
 		 99 aa  140  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  66.67 
 
 		 111 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0824  hypothetical protein  63.64 
 
 		 103 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  62.63 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1473  hypothetical protein  60.58 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4170  hypothetical protein  59 
 
 		 100 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1938  hypothetical protein  57.14 
 
 		 108 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000407914  normal  0.0922297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  60.23 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0191  hypothetical protein  54.37 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134855  hitchhiker  0.000327701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4148  hypothetical protein  53 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4813  hypothetical protein  59 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.927854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3736  hypothetical protein  59 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  48.04 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  48.04 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  45.19 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17110  hypothetical protein  52 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118524  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  47.52 
 
 		 107 aa  91.3  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  47 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  47.52 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  48.04 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2674  hypothetical protein  53.33 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.147046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  46.08 
 
 		 590 aa  83.6  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  45.1 
 
 		 590 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3667  hypothetical protein  46.6 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.628036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0714  hypothetical protein  45.19 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.74634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  45.1 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  45.19 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  45.19 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  41.75 
 
 		 599 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  41.18 
 
 		 608 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3391  hypothetical protein  44.66 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  0.0862891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  43.43 
 
 		 616 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  35.58 
 
 		 603 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  40 
 
 		 612 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18510  hypothetical protein  45.36 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  37.14 
 
 		 598 aa  72  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  39 
 
 		 627 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  38.1 
 
 		 596 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  36.19 
 
 		 600 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  36.19 
 
 		 600 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  34.31 
 
 		 578 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  36.67 
 
 		 571 aa  58.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  37.5 
 
 		 580 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  35.64 
 
 		 562 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  33.98 
 
 		 587 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  34.02 
 
 		 570 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  35.29 
 
 		 562 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  34.34 
 
 		 560 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 596 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  31.48 
 
 		 607 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  35.87 
 
 		 619 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  33.33 
 
 		 581 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  32.54 
 
 		 654 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  36.08 
 
 		 578 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  35.24 
 
 		 574 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  35.24 
 
 		 574 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  35.24 
 
 		 574 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  32.98 
 
 		 588 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  27.72 
 
 		 587 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  29.41 
 
 		 561 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  32.41 
 
 		 575 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  32.41 
 
 		 575 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  32.41 
 
 		 575 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  30.21 
 
 		 596 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>