117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4598 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  82.09 
 
 
574 aa  928    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  82.09 
 
 
574 aa  928    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  59.49 
 
 
587 aa  671    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  82.09 
 
 
574 aa  928    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1163    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  57.36 
 
 
594 aa  616  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  58.62 
 
 
581 aa  611  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  55.2 
 
 
619 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  54.43 
 
 
570 aa  578  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  55.9 
 
 
575 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  55.73 
 
 
575 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  55.73 
 
 
575 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  53.9 
 
 
562 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  54.68 
 
 
587 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  54.72 
 
 
584 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  55.67 
 
 
561 aa  561  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  52.18 
 
 
596 aa  557  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  53.77 
 
 
562 aa  556  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  54.75 
 
 
578 aa  551  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  54.83 
 
 
560 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  52.01 
 
 
588 aa  525  1e-148  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  50.43 
 
 
580 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  50.26 
 
 
596 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  37.91 
 
 
590 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  35.85 
 
 
598 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  35 
 
 
600 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  35.38 
 
 
612 aa  294  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  31.89 
 
 
654 aa  291  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  34.27 
 
 
596 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  34.17 
 
 
600 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  35.86 
 
 
599 aa  283  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  35.31 
 
 
607 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  36.98 
 
 
590 aa  280  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  34.08 
 
 
603 aa  277  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  34.75 
 
 
608 aa  267  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  34.5 
 
 
627 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  35.31 
 
 
616 aa  253  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  33.1 
 
 
571 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  40.44 
 
 
451 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  40.44 
 
 
451 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  40.71 
 
 
445 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  43.93 
 
 
453 aa  224  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  37.81 
 
 
446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  36.9 
 
 
450 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  40.71 
 
 
452 aa  218  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  37.26 
 
 
446 aa  217  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  39.62 
 
 
445 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  41.33 
 
 
450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  33.71 
 
 
587 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  40.75 
 
 
450 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  42.47 
 
 
453 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  41.82 
 
 
442 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  41.64 
 
 
452 aa  208  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  44.69 
 
 
453 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  41.92 
 
 
461 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  41.92 
 
 
461 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  41.92 
 
 
461 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  40.31 
 
 
444 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  36.84 
 
 
445 aa  203  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  39.94 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  40.31 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  39.94 
 
 
445 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  41.46 
 
 
466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  38.77 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  41.25 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  43.12 
 
 
453 aa  198  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  38.05 
 
 
445 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  39.56 
 
 
444 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  34.62 
 
 
448 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  37.81 
 
 
445 aa  194  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  34.29 
 
 
451 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  33.63 
 
 
451 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  37.3 
 
 
441 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  39.94 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  40.06 
 
 
473 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  37.46 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  43.87 
 
 
449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  34.69 
 
 
454 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  34.97 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  34.86 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  36.19 
 
 
443 aa  164  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  39.42 
 
 
103 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  39.81 
 
 
111 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  42.39 
 
 
105 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  41.05 
 
 
108 aa  58.9  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  35.85 
 
 
122 aa  57  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  35.85 
 
 
123 aa  57  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  36.84 
 
 
505 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  37.23 
 
 
99 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0714  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.74634  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1228  hypothetical protein  35.87 
 
 
99 aa  55.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  32.2 
 
 
114 aa  54.7  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  39.08 
 
 
107 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  37.23 
 
 
99 aa  54.7  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0824  hypothetical protein  37.37 
 
 
103 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  32.41 
 
 
116 aa  53.9  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  36 
 
 
103 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4170  hypothetical protein  37.35 
 
 
100 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0191  hypothetical protein  31.68 
 
 
108 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134855  hitchhiker  0.000327701 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>