122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4325 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  63.36 
 
 
581 aa  652    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  64.49 
 
 
561 aa  659    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  63.08 
 
 
575 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  63.08 
 
 
575 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  63.06 
 
 
570 aa  661    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  63.08 
 
 
575 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  100 
 
 
562 aa  1102    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  90.21 
 
 
562 aa  972    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  60.56 
 
 
587 aa  634    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  62.99 
 
 
560 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  62.48 
 
 
578 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  58.98 
 
 
580 aa  587  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  58.74 
 
 
584 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  54.45 
 
 
578 aa  581  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  56 
 
 
574 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  56 
 
 
574 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  56 
 
 
574 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  58.17 
 
 
596 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  50.76 
 
 
587 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  52.5 
 
 
619 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  50.68 
 
 
594 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  50.93 
 
 
588 aa  503  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  49.06 
 
 
596 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  36.53 
 
 
612 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  35.23 
 
 
600 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  33.77 
 
 
596 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  34.9 
 
 
600 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  36.58 
 
 
607 aa  283  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  35.23 
 
 
608 aa  279  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  35.97 
 
 
616 aa  279  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  32.37 
 
 
654 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  43.58 
 
 
598 aa  269  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  36.44 
 
 
590 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  35.16 
 
 
599 aa  264  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  31.86 
 
 
603 aa  256  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  34.55 
 
 
627 aa  252  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  43.07 
 
 
590 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  35.12 
 
 
571 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  36.36 
 
 
587 aa  229  9e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  43.08 
 
 
452 aa  217  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  38.83 
 
 
445 aa  216  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  43.64 
 
 
450 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  45.11 
 
 
453 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  45.96 
 
 
453 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  40.11 
 
 
445 aa  213  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  44.65 
 
 
450 aa  212  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  42.06 
 
 
453 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  44.65 
 
 
450 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  38.66 
 
 
451 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  38.66 
 
 
451 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  37.33 
 
 
445 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  38.86 
 
 
444 aa  209  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  43.08 
 
 
452 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  42.9 
 
 
458 aa  205  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  37.22 
 
 
446 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  43.08 
 
 
461 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  43.08 
 
 
461 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  43.08 
 
 
461 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  37.85 
 
 
454 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  39.59 
 
 
442 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  41.83 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  38.98 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  36.68 
 
 
446 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  38.75 
 
 
445 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  42.14 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  42.06 
 
 
452 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  42.46 
 
 
473 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  36.01 
 
 
445 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  41.94 
 
 
444 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  37.33 
 
 
451 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  44.41 
 
 
466 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  37.64 
 
 
451 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  38.92 
 
 
445 aa  193  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  35.77 
 
 
448 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  36.49 
 
 
451 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  40.95 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  39.38 
 
 
454 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  33.69 
 
 
445 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  38.01 
 
 
441 aa  184  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  41.21 
 
 
443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  40.39 
 
 
449 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  38 
 
 
505 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0191  hypothetical protein  35.92 
 
 
108 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134855  hitchhiker  0.000327701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17110  hypothetical protein  37 
 
 
110 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  37.61 
 
 
120 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0714  hypothetical protein  34.86 
 
 
123 aa  61.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.74634  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  37.61 
 
 
120 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  36.79 
 
 
122 aa  61.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  38 
 
 
123 aa  58.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  38.61 
 
 
103 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  38.61 
 
 
103 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  35.79 
 
 
103 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  38 
 
 
103 aa  57  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  32.41 
 
 
114 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  34 
 
 
114 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  34.62 
 
 
121 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  33.01 
 
 
108 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  37.62 
 
 
103 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1938  hypothetical protein  34.78 
 
 
108 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000407914  normal  0.0922297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4092  hypothetical protein  35.29 
 
 
104 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>