79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4813 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4813  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.927854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3736  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  69.31 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  63 
 
 		 99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4170  hypothetical protein  68 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  62 
 
 		 99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1473  hypothetical protein  64.36 
 
 		 104 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  66 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  64.36 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0824  hypothetical protein  60.78 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  64.36 
 
 		 111 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  69.31 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1228  hypothetical protein  58.16 
 
 		 99 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  59.41 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  57.43 
 
 		 505 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6326  hypothetical protein  59 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.681991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4092  hypothetical protein  59 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  57.43 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4148  hypothetical protein  52.94 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  56.44 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  56.44 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1347  hypothetical protein  56.44 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0599686 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1369  hypothetical protein  55.45 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.775913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0887  hypothetical protein  55.45 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  54 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  49.04 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2674  hypothetical protein  59.78 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.147046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1938  hypothetical protein  50.94 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000407914  normal  0.0922297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0191  hypothetical protein  49 
 
 		 108 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134855  hitchhiker  0.000327701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  48 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  53.47 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  47 
 
 		 116 aa  90.5  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0714  hypothetical protein  48.6 
 
 		 123 aa  90.5  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.74634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  52.48 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  50 
 
 		 599 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18510  hypothetical protein  52.48 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  54 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  54 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  52.08 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17110  hypothetical protein  48.98 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  48 
 
 		 590 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  45 
 
 		 608 aa  80.5  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  46.53 
 
 		 590 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  47.42 
 
 		 627 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3667  hypothetical protein  45.28 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.628036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3391  hypothetical protein  48 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  0.0862891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  42.27 
 
 		 616 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  41.18 
 
 		 596 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  39.8 
 
 		 612 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  39 
 
 		 603 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  40.59 
 
 		 600 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  40.59 
 
 		 600 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  41.49 
 
 		 571 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  37.62 
 
 		 598 aa  60.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  42.05 
 
 		 619 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  37.76 
 
 		 596 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  35.92 
 
 		 562 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  35.71 
 
 		 588 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  38.14 
 
 		 578 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  33.98 
 
 		 578 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  34.62 
 
 		 587 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  35.42 
 
 		 562 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  33.33 
 
 		 587 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  34 
 
 		 570 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  35.42 
 
 		 580 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  31.25 
 
 		 561 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  32.65 
 
 		 607 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  32.95 
 
 		 581 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  33 
 
 		 560 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  35.29 
 
 		 574 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  35.29 
 
 		 574 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  35.29 
 
 		 574 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  32.71 
 
 		 575 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  32.71 
 
 		 575 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  32.71 
 
 		 575 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  34.72 
 
 		 654 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  29.79 
 
 		 584 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  31.91 
 
 		 596 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>