90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4555 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1165    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  63.13 
 
 		 581 aa  663    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  60.28 
 
 		 570 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  59.59 
 
 		 575 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  59.59 
 
 		 575 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  59.59 
 
 		 575 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  60.52 
 
 		 561 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  58.35 
 
 		 587 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  60.1 
 
 		 560 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  59.72 
 
 		 578 aa  591  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  58.74 
 
 		 562 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  54.72 
 
 		 578 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  58.23 
 
 		 562 aa  555  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  54.04 
 
 		 574 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  54.04 
 
 		 574 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  54.04 
 
 		 574 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  52.36 
 
 		 580 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  53.79 
 
 		 596 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  48.67 
 
 		 587 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  48.29 
 
 		 619 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  50.42 
 
 		 594 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  46.51 
 
 		 596 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  44.52 
 
 		 588 aa  435  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  34.48 
 
 		 612 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  30.99 
 
 		 654 aa  277  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  35.52 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  32.95 
 
 		 600 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  34.28 
 
 		 608 aa  270  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  32.9 
 
 		 600 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  32.73 
 
 		 596 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  33.72 
 
 		 607 aa  249  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  31.59 
 
 		 603 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  34.28 
 
 		 590 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  33.12 
 
 		 616 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  32.62 
 
 		 599 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  32.28 
 
 		 627 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  35.15 
 
 		 587 aa  223  6e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  33.61 
 
 		 590 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  43.15 
 
 		 450 aa  216  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  42.24 
 
 		 450 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  32.63 
 
 		 571 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  41.79 
 
 		 450 aa  212  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  40.11 
 
 		 452 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  42.25 
 
 		 453 aa  203  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  38.61 
 
 		 445 aa  200  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  42.02 
 
 		 452 aa  199  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  38.24 
 
 		 451 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  38.24 
 
 		 451 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  36.31 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  40.73 
 
 		 482 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  41.49 
 
 		 473 aa  193  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  41.71 
 
 		 453 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  35.93 
 
 		 446 aa  190  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  41.71 
 
 		 453 aa  191  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  40.72 
 
 		 452 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  41.18 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  36.23 
 
 		 446 aa  189  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  41.18 
 
 		 461 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  41.18 
 
 		 461 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  41.98 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  38.55 
 
 		 445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  34.26 
 
 		 445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  38.67 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  40.11 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  42.25 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  35.8 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  40 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  34.76 
 
 		 451 aa  179  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  38.42 
 
 		 444 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  38.61 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  38.92 
 
 		 451 aa  177  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  38.44 
 
 		 445 aa  176  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  36.1 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  35.21 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  34.9 
 
 		 445 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  36.42 
 
 		 454 aa  170  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  40.13 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  34.84 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  35.92 
 
 		 445 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  34.93 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  39.88 
 
 		 443 aa  157  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  34.02 
 
 		 103 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  34.65 
 
 		 111 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  35.48 
 
 		 105 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  34.02 
 
 		 108 aa  47.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  32.99 
 
 		 505 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  32.98 
 
 		 99 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4170  hypothetical protein  29.29 
 
 		 100 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  32.98 
 
 		 99 aa  45.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0714  hypothetical protein  28.69 
 
 		 123 aa  43.9  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.74634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>