130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2689 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  75.13 
 
 		 596 aa  907    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  80.84 
 
 		 600 aa  968    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  65.99 
 
 		 598 aa  783    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1246    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  80 
 
 		 600 aa  959    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  53.49 
 
 		 590 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  52.75 
 
 		 616 aa  575  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  48.33 
 
 		 603 aa  554  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  49.17 
 
 		 599 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  52.12 
 
 		 590 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  48.25 
 
 		 627 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  47.39 
 
 		 608 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  43.19 
 
 		 607 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  45.42 
 
 		 571 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  38.72 
 
 		 596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  36.99 
 
 		 619 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  36.79 
 
 		 587 aa  321  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  36.33 
 
 		 570 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  36.53 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  37.16 
 
 		 560 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  36.56 
 
 		 574 aa  309  9e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  36.56 
 
 		 574 aa  309  9e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  36.56 
 
 		 574 aa  309  9e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  36.23 
 
 		 562 aa  299  9e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  35.48 
 
 		 587 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  35.38 
 
 		 578 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  35.54 
 
 		 575 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  35.54 
 
 		 575 aa  297  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  35.54 
 
 		 575 aa  297  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  34.28 
 
 		 581 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  34.29 
 
 		 588 aa  293  5e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  36.03 
 
 		 578 aa  290  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  34.48 
 
 		 584 aa  282  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  36.2 
 
 		 580 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  34.28 
 
 		 594 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  37.81 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  37.81 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  38.08 
 
 		 445 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  40.75 
 
 		 482 aa  254  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  44.25 
 
 		 561 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  38.08 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  40.58 
 
 		 445 aa  247  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  41.76 
 
 		 445 aa  246  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  34.51 
 
 		 446 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  36.65 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  33.5 
 
 		 596 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  36.65 
 
 		 450 aa  243  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  36.5 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  35.09 
 
 		 446 aa  242  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  34.37 
 
 		 448 aa  240  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  36 
 
 		 454 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  39.63 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  33.71 
 
 		 445 aa  236  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  35.19 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  36.02 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  35.63 
 
 		 451 aa  231  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  36.78 
 
 		 451 aa  230  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  38.93 
 
 		 445 aa  228  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  38.89 
 
 		 452 aa  228  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  39.65 
 
 		 453 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  36.47 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  32.53 
 
 		 454 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  33.19 
 
 		 473 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  40.16 
 
 		 453 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  34.24 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  39.01 
 
 		 453 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  38.94 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  38.94 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  38.99 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  33.66 
 
 		 445 aa  220  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  39.68 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  38.76 
 
 		 445 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  33.77 
 
 		 458 aa  216  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  34.65 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  39.1 
 
 		 453 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  34.66 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  36.13 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  38.21 
 
 		 466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  39.35 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  32.45 
 
 		 587 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 		 654 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1909  hypothetical protein  42.4 
 
 		 120 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.701589  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  48.25 
 
 		 116 aa  87  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1819  hypothetical protein  42.4 
 
 		 120 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  85.1  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  41.18 
 
 		 121 aa  84.3  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  44.74 
 
 		 116 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  38.52 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3391  hypothetical protein  45.22 
 
 		 130 aa  81.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  0.0862891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  41.9 
 
 		 103 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  78.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  42.72 
 
 		 103 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  41.75 
 
 		 103 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1938  hypothetical protein  45.19 
 
 		 108 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000407914  normal  0.0922297 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  39.25 
 
 		 114 aa  75.1  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4092  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  40.78 
 
 		 103 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  42.86 
 
 		 103 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5399  hypothetical protein  35.85 
 
 		 114 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  41.38 
 
 		 123 aa  72.8  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>