90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1227 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  911    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  70.67 
 
 
446 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  69.98 
 
 
446 aa  643    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  61.7 
 
 
452 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  59.59 
 
 
445 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  60.91 
 
 
452 aa  538  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  58.97 
 
 
451 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  58.97 
 
 
451 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  62.07 
 
 
452 aa  538  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  61.22 
 
 
444 aa  534  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  60.23 
 
 
445 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  58.92 
 
 
444 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  58.73 
 
 
445 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  60.72 
 
 
445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  56.22 
 
 
454 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  57.73 
 
 
445 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  58.64 
 
 
453 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  58.86 
 
 
453 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  54.18 
 
 
454 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  57.73 
 
 
461 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  57.73 
 
 
461 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  57.95 
 
 
461 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  58.64 
 
 
453 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  57.27 
 
 
452 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  51.13 
 
 
441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  52.22 
 
 
445 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  51.13 
 
 
442 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  50 
 
 
445 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  47.95 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  45.7 
 
 
451 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  46.15 
 
 
451 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  45.5 
 
 
451 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  48.76 
 
 
443 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  43.3 
 
 
450 aa  353  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  43.08 
 
 
450 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  42.89 
 
 
450 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  42.42 
 
 
482 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  44.47 
 
 
453 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  42.58 
 
 
473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  42.73 
 
 
458 aa  332  6e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  44.47 
 
 
466 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  42.45 
 
 
449 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  36.23 
 
 
598 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  35.19 
 
 
596 aa  249  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  35.16 
 
 
600 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  35.16 
 
 
600 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  34.37 
 
 
612 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  38.53 
 
 
590 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  33.77 
 
 
607 aa  223  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  34.29 
 
 
590 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  38.2 
 
 
596 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  33.33 
 
 
616 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  31.19 
 
 
603 aa  210  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  34.01 
 
 
608 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  34.62 
 
 
578 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  39.18 
 
 
574 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  35.83 
 
 
627 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  39.18 
 
 
574 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  39.18 
 
 
574 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  32.58 
 
 
571 aa  194  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  35.77 
 
 
562 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  36.69 
 
 
581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  32.37 
 
 
599 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  35.67 
 
 
619 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  34.55 
 
 
560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  35.6 
 
 
588 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  36.59 
 
 
575 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  36.28 
 
 
575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  36.28 
 
 
575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  32.88 
 
 
587 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  32.97 
 
 
587 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  34.71 
 
 
562 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  36.36 
 
 
561 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  32.68 
 
 
570 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  34.69 
 
 
594 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  33.77 
 
 
596 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  34.84 
 
 
584 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  32.6 
 
 
578 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  33.33 
 
 
580 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  29.55 
 
 
587 aa  133  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  28.42 
 
 
654 aa  126  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  31.19 
 
 
461 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  25.56 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  26.85 
 
 
445 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  24.49 
 
 
451 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  24.23 
 
 
452 aa  47.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  29.94 
 
 
452 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  27.07 
 
 
455 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  33.06 
 
 
452 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  31.67 
 
 
456 aa  43.1  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.719749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>