43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1119 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  931    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  49.22 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  50.78 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  45.76 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  43.24 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  44.9 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  44.67 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  44.39 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  39.69 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  35.15 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  33.7 
 
 		 469 aa  279  9e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  32.51 
 
 		 451 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  32.95 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  31.88 
 
 		 484 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  32.78 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  25.53 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  25.53 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  30.34 
 
 		 443 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  29.83 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  29.12 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  25.93 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  27.88 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  27.85 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  25.91 
 
 		 453 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  25.82 
 
 		 461 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  24.91 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  26.07 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  26.07 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  25.45 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  25.23 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  25.35 
 
 		 590 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  27.85 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  27.04 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  26.8 
 
 		 608 aa  47  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  26.81 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  21.81 
 
 		 603 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  23.94 
 
 		 599 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  28.57 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  23.89 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  24.48 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  22.58 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  26.4 
 
 		 607 aa  44.3  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  24.16 
 
 		 616 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>