26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1876 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  931    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  62.7 
 
 		 461 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  56 
 
 		 452 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  55.95 
 
 		 456 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  55.73 
 
 		 456 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  49.33 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  50.78 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  43.86 
 
 		 452 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  42.57 
 
 		 452 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  37.47 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  38.26 
 
 		 469 aa  326  6e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  35.12 
 
 		 451 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  35.68 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  34.64 
 
 		 484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  29.78 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  28.46 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  31.98 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  26.22 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  27.92 
 
 		 596 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  29.31 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  27.07 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  26.61 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  27.69 
 
 		 590 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  28.76 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  26.59 
 
 		 453 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  36.71 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>