25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1343 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  897    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  54.36 
 
 
461 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  47.76 
 
 
452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  49.33 
 
 
455 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  48.65 
 
 
456 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  48.43 
 
 
456 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  43.24 
 
 
452 aa  363  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  37.64 
 
 
452 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  41.99 
 
 
452 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  36.28 
 
 
469 aa  296  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  31.96 
 
 
464 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  31.21 
 
 
451 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  33.41 
 
 
464 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  33.26 
 
 
484 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  25.3 
 
 
441 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  27.67 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  26.85 
 
 
448 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  27.04 
 
 
446 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  25.93 
 
 
453 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  26.37 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  25.25 
 
 
596 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  24.59 
 
 
451 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  28.87 
 
 
445 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  26.09 
 
 
452 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  26.84 
 
 
445 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>