88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0825 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  81.76 
 
 		 445 aa  726    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  896    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  66.29 
 
 		 444 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  64.33 
 
 		 452 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  64.72 
 
 		 445 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  64.49 
 
 		 445 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  65.01 
 
 		 444 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  61.71 
 
 		 446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  61.26 
 
 		 446 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  64.11 
 
 		 453 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  61.61 
 
 		 451 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  61.61 
 
 		 451 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  63.66 
 
 		 452 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  59.46 
 
 		 445 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  63.21 
 
 		 461 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  63.21 
 
 		 461 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  63.43 
 
 		 453 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  59.68 
 
 		 452 aa  545  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  60.23 
 
 		 448 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  63.21 
 
 		 461 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  63.21 
 
 		 453 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  63.21 
 
 		 452 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  59.33 
 
 		 454 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  52.36 
 
 		 454 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  52.6 
 
 		 441 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  52.46 
 
 		 445 aa  465  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  45.86 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  45.29 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  47.97 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  49.32 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  45.43 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  47.63 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  47.2 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  45.6 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  45.82 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  48.75 
 
 		 443 aa  362  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  46.12 
 
 		 482 aa  362  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  45.8 
 
 		 453 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  45.09 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  45.21 
 
 		 473 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  45.1 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  45.52 
 
 		 466 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  41.49 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  40 
 
 		 590 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  42.68 
 
 		 603 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  43.12 
 
 		 596 aa  246  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  35.32 
 
 		 607 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  39.35 
 
 		 600 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  39.05 
 
 		 600 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  39.62 
 
 		 578 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  38.37 
 
 		 619 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  38.57 
 
 		 590 aa  226  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  38.68 
 
 		 616 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  38.76 
 
 		 612 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  37.29 
 
 		 581 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  37.33 
 
 		 562 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  39.05 
 
 		 587 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  33.03 
 
 		 627 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  39.01 
 
 		 596 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  33.26 
 
 		 599 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  38.21 
 
 		 561 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  35.47 
 
 		 570 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  38.95 
 
 		 574 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  38.95 
 
 		 574 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  38.95 
 
 		 574 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  38.92 
 
 		 575 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  38.61 
 
 		 575 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  38.61 
 
 		 575 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  33.42 
 
 		 608 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  36.78 
 
 		 587 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  40.41 
 
 		 571 aa  206  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  36.31 
 
 		 560 aa  202  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  36.84 
 
 		 562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  37.38 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  39.88 
 
 		 594 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  34.26 
 
 		 584 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  34.29 
 
 		 596 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  35.51 
 
 		 578 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  37.27 
 
 		 580 aa  180  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  29.93 
 
 		 654 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  30.75 
 
 		 587 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  31.45 
 
 		 452 aa  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  27.56 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  23.11 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  28.19 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  28.31 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  23.3 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  25.57 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>