50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1720 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  947    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  54.15 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  38.8 
 
 		 461 aa  346  5e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  37.47 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  38.05 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  37.58 
 
 		 464 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  35.53 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  37.17 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  35.07 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  31.96 
 
 		 445 aa  273  5.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  34.35 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  34.84 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  34.88 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  31.96 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  28.41 
 
 		 451 aa  67  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  27.31 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  25.88 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  27.82 
 
 		 451 aa  57  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  26.79 
 
 		 616 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  28.09 
 
 		 590 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  27.5 
 
 		 445 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  25.31 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  26.32 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  28.69 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  29.09 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  28.4 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  28.07 
 
 		 453 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  25.85 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  28.66 
 
 		 482 aa  50.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  28.14 
 
 		 454 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  27.75 
 
 		 453 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  25.29 
 
 		 587 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  27.19 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  29.57 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  26.75 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  26.87 
 
 		 461 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  27.27 
 
 		 596 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  27.85 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  25.31 
 
 		 599 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  26.87 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  26.87 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  23.11 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  27.08 
 
 		 603 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  24.08 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  29.05 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  23.6 
 
 		 587 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  25 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  23.92 
 
 		 598 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  25 
 
 		 612 aa  43.9  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  27.16 
 
 		 445 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>