23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0748 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  99.34 
 
 		 456 aa  933    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  939    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  55.73 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  55.95 
 
 		 455 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  56.01 
 
 		 452 aa  494  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  48.65 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  44.22 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  43.81 
 
 		 452 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  44.9 
 
 		 452 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  36.89 
 
 		 469 aa  309  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  35.07 
 
 		 464 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  35.43 
 
 		 464 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  34.93 
 
 		 484 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  31.93 
 
 		 451 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  29.71 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  26.64 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  26.84 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  26.35 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  27.59 
 
 		 443 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  29.55 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  28.31 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  25.09 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  31.67 
 
 		 448 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>