85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3292 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  889    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  64.94 
 
 
452 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  60.91 
 
 
448 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  59.68 
 
 
445 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  62.59 
 
 
445 aa  531  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  59.18 
 
 
446 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  64.77 
 
 
445 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  60.41 
 
 
445 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  58.96 
 
 
446 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  61.78 
 
 
452 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  61.04 
 
 
444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  62.89 
 
 
453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  62.36 
 
 
461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  62.36 
 
 
461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  62.81 
 
 
452 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  62.16 
 
 
444 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  61.69 
 
 
453 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  59.68 
 
 
451 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  62.58 
 
 
461 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  59.68 
 
 
451 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  60.09 
 
 
445 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  58.22 
 
 
454 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  62.44 
 
 
453 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  56.21 
 
 
454 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  55.66 
 
 
445 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  55.23 
 
 
441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  50.22 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  50 
 
 
451 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  51.25 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  51.14 
 
 
445 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  52.19 
 
 
442 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  47.44 
 
 
451 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  48.42 
 
 
450 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  48.87 
 
 
450 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  47.4 
 
 
450 aa  358  8e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  50.79 
 
 
443 aa  356  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  47.05 
 
 
458 aa  349  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  47.06 
 
 
482 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  46.83 
 
 
473 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  46.52 
 
 
453 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  47.37 
 
 
449 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  45.45 
 
 
466 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  36.55 
 
 
590 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  37.33 
 
 
596 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  40.5 
 
 
598 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  34.97 
 
 
603 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  38.15 
 
 
600 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  36.09 
 
 
607 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  37.47 
 
 
600 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  36.02 
 
 
612 aa  225  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  35.96 
 
 
590 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  38.08 
 
 
616 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  37.66 
 
 
608 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  40.11 
 
 
596 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  42.18 
 
 
581 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  40.46 
 
 
619 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  38.67 
 
 
587 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  43.04 
 
 
574 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  43.04 
 
 
574 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  43.04 
 
 
574 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  33.55 
 
 
627 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  33.76 
 
 
599 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  40.31 
 
 
578 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  40.06 
 
 
570 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  38.98 
 
 
562 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  42.02 
 
 
584 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  41.14 
 
 
575 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  41.14 
 
 
575 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  41.51 
 
 
560 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  41.14 
 
 
575 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  40.05 
 
 
596 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  41.1 
 
 
561 aa  194  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  41.18 
 
 
588 aa  193  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  39.1 
 
 
571 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  31.75 
 
 
587 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  34.85 
 
 
578 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  40.3 
 
 
594 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  37.4 
 
 
562 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  37.32 
 
 
580 aa  176  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  32.6 
 
 
587 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  30.46 
 
 
654 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  31.82 
 
 
461 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  26.94 
 
 
484 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  29.55 
 
 
456 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  28.98 
 
 
456 aa  43.1  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>