50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0538 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  947    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  68.35 
 
 		 484 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  38.38 
 
 		 469 aa  316  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  37.89 
 
 		 461 aa  305  8.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  37.58 
 
 		 464 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  35.68 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  35.43 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  35.2 
 
 		 456 aa  266  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  37.11 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  33.86 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  33.41 
 
 		 445 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  32.95 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  32.32 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  30.65 
 
 		 451 aa  194  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  25.85 
 
 		 627 aa  60.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  26.52 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  28.7 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  28.25 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  26.45 
 
 		 612 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  26.46 
 
 		 616 aa  57.4  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  23.31 
 
 		 441 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  25.44 
 
 		 571 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  25.5 
 
 		 608 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  27.27 
 
 		 596 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  24.56 
 
 		 445 aa  53.9  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  25.23 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  25.77 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  29.05 
 
 		 600 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  29.13 
 
 		 575 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  24.82 
 
 		 607 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  24.37 
 
 		 453 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  25.56 
 
 		 451 aa  50.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  29.13 
 
 		 575 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  25.48 
 
 		 600 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  29.13 
 
 		 575 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  21.69 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  25.81 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  25.81 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  25.81 
 
 		 461 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  23.01 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  27.88 
 
 		 458 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  28.19 
 
 		 570 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  25 
 
 		 453 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  28.65 
 
 		 587 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  24.3 
 
 		 599 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  30.22 
 
 		 562 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  26.95 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  27.39 
 
 		 578 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  23.27 
 
 		 598 aa  43.5  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  22.43 
 
 		 444 aa  43.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>