57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0486 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  68.35 
 
 
464 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  980    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  40.27 
 
 
469 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  37.14 
 
 
461 aa  293  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  37.17 
 
 
464 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  37.41 
 
 
452 aa  256  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  34.64 
 
 
455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  34.93 
 
 
456 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  34.93 
 
 
456 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  33.18 
 
 
452 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  33.26 
 
 
445 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  31.88 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  34.38 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  31.18 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  29.86 
 
 
451 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  26.87 
 
 
445 aa  64.3  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  29.44 
 
 
596 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  29.14 
 
 
608 aa  60.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  28.57 
 
 
607 aa  60.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  27.94 
 
 
612 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  26.48 
 
 
454 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  26.46 
 
 
451 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  27.51 
 
 
600 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  26.26 
 
 
451 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  29.95 
 
 
600 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  25.16 
 
 
627 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  25.61 
 
 
453 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  28.38 
 
 
454 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  25.76 
 
 
441 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  25.88 
 
 
450 aa  50.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  25.88 
 
 
450 aa  50.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  24.46 
 
 
446 aa  50.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  26.3 
 
 
461 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  26.3 
 
 
461 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  27.54 
 
 
473 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  29.41 
 
 
616 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  26.51 
 
 
450 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  26.94 
 
 
452 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  30.72 
 
 
461 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  30.72 
 
 
452 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  27.24 
 
 
452 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  31.33 
 
 
453 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  29.94 
 
 
458 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  25.11 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  30 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  30.72 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  28.02 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  25.77 
 
 
571 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  25.87 
 
 
444 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  28.45 
 
 
482 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  24.91 
 
 
445 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  27.71 
 
 
599 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  29.7 
 
 
445 aa  43.9  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  30.53 
 
 
575 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  30.53 
 
 
575 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  30.53 
 
 
575 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  24.89 
 
 
445 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>