51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2427 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  915    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  47.66 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  44.74 
 
 		 452 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  44.03 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  44.03 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  42.57 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  42.21 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  43.72 
 
 		 452 aa  358  8e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  39.87 
 
 		 452 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  35.56 
 
 		 464 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  32.81 
 
 		 451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  33.26 
 
 		 469 aa  236  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  32.75 
 
 		 464 aa  233  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  34.38 
 
 		 484 aa  226  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  28.12 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  33.49 
 
 		 445 aa  57  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  31.22 
 
 		 608 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  29.72 
 
 		 580 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  36.22 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  32.29 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  31.96 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  31.96 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  31.96 
 
 		 461 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  31.96 
 
 		 461 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  31.77 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  29.61 
 
 		 451 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  29.72 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  31.45 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  30.67 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  24.43 
 
 		 603 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  26.38 
 
 		 607 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  31.61 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  29.75 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  30.32 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  30.77 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  30.13 
 
 		 450 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  31.65 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  29.63 
 
 		 619 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  30.13 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  29.94 
 
 		 451 aa  47  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  29.03 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  29.94 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  27.74 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  27.33 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  29.68 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  30.32 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  25.81 
 
 		 598 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  25.98 
 
 		 596 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  29.69 
 
 		 600 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  27.56 
 
 		 612 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  29.35 
 
 		 600 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>