32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3993 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  921    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  34.3 
 
 		 461 aa  299  7e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  35.12 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  33.63 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  31.21 
 
 		 445 aa  249  5e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  31.93 
 
 		 456 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  31.93 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  32.67 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  32.51 
 
 		 452 aa  236  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  31.96 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  31.65 
 
 		 469 aa  229  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  32.81 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  30.65 
 
 		 464 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  31.18 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  28.25 
 
 		 461 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  28.25 
 
 		 461 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  28.63 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  25.39 
 
 		 607 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  28.15 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  28.23 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  23.27 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  27.37 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  24.49 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  28.28 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  27.21 
 
 		 453 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  29 
 
 		 445 aa  47  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  27.16 
 
 		 452 aa  46.6  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  25.73 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  26.72 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  25.96 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  25.22 
 
 		 584 aa  43.1  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  26.48 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>