21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0828 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  939    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  99.34 
 
 
456 aa  933    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  55.51 
 
 
461 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  55.73 
 
 
455 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  56.01 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  48.43 
 
 
445 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  43.99 
 
 
452 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  43.81 
 
 
452 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  44.67 
 
 
452 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  36.89 
 
 
469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  34.84 
 
 
464 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  35.2 
 
 
464 aa  266  8e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  34.93 
 
 
484 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  31.93 
 
 
451 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  29.14 
 
 
445 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  26.52 
 
 
450 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  26.25 
 
 
441 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  25.99 
 
 
607 aa  47  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  25.44 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  27.01 
 
 
443 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  28.98 
 
 
452 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>