50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3213 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  917    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  56 
 
 		 455 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  55.66 
 
 		 461 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0748  hypothetical protein  56.01 
 
 		 456 aa  494  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.719749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0828  hypothetical protein  56.01 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1343  hypothetical protein  47.76 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  43.33 
 
 		 452 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2427  hypothetical protein  44.74 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807516  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1119  hypothetical protein  45.31 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  38.05 
 
 		 464 aa  318  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  38.55 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  37.11 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  37.41 
 
 		 484 aa  256  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  33.63 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  26.23 
 
 		 608 aa  63.2  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  31.08 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  27.17 
 
 		 600 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  26.69 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  27.82 
 
 		 600 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  27.85 
 
 		 607 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  27.44 
 
 		 599 aa  53.5  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  25 
 
 		 612 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  25.4 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  26.51 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  25.4 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  32.14 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  26.17 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  30.04 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  25.2 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  25.64 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  26.38 
 
 		 596 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  28.18 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  27.35 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  26.47 
 
 		 571 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  26.84 
 
 		 616 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  25.94 
 
 		 445 aa  46.6  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  28.17 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  26.37 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  24.49 
 
 		 598 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  23.32 
 
 		 603 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  26.84 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  27.07 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  28.76 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  26.89 
 
 		 454 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  25.69 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  33.61 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  33.06 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  25.76 
 
 		 458 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  26.58 
 
 		 451 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  26.58 
 
 		 451 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>