82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3735 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  100 
 
 		 451 aa  899    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  100 
 
 		 451 aa  899    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  72.77 
 
 		 445 aa  616  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  72.54 
 
 		 444 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  67.79 
 
 		 452 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  71.88 
 
 		 445 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  68.61 
 
 		 444 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  65.62 
 
 		 452 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  64.88 
 
 		 445 aa  555  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  69.35 
 
 		 453 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  68.2 
 
 		 461 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  68.2 
 
 		 461 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  68.66 
 
 		 461 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  61.61 
 
 		 445 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  61.3 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  68.66 
 
 		 452 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  69.59 
 
 		 453 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  64.88 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  58.97 
 
 		 448 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  59.51 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  59.96 
 
 		 446 aa  534  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  60.49 
 
 		 454 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  59.68 
 
 		 452 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  57.02 
 
 		 454 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  54.61 
 
 		 441 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  52.49 
 
 		 445 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  48.56 
 
 		 451 aa  408  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  52.46 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  47.77 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  46.88 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  51.84 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  51.98 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  49.01 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  50.11 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  48.31 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  50.46 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  47.86 
 
 		 450 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  47.54 
 
 		 482 aa  360  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  47.71 
 
 		 473 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  48.68 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  49.89 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  48.12 
 
 		 449 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  36.7 
 
 		 603 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  45.53 
 
 		 590 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  38.69 
 
 		 596 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  41.11 
 
 		 607 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  45.82 
 
 		 590 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  38.65 
 
 		 600 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  37.64 
 
 		 598 aa  253  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  37.81 
 
 		 612 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  38.2 
 
 		 600 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  38.07 
 
 		 616 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  37.94 
 
 		 608 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  35.16 
 
 		 599 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  40.44 
 
 		 578 aa  229  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  33.48 
 
 		 627 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  39.37 
 
 		 596 aa  226  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  35.57 
 
 		 587 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  38.05 
 
 		 571 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  42.12 
 
 		 619 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  41.32 
 
 		 574 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  41.32 
 
 		 574 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  41.32 
 
 		 574 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  38.83 
 
 		 581 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  38.66 
 
 		 562 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  37.7 
 
 		 587 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  36.34 
 
 		 596 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  39.12 
 
 		 560 aa  204  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  40.18 
 
 		 561 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  37.97 
 
 		 575 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  37.97 
 
 		 575 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  37.97 
 
 		 575 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  38.24 
 
 		 584 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  38.55 
 
 		 570 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  39.33 
 
 		 588 aa  196  6e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  37.4 
 
 		 562 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  40.57 
 
 		 594 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  37.9 
 
 		 578 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  36.45 
 
 		 580 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  30.02 
 
 		 654 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  29.73 
 
 		 587 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  26.58 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>