85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2040 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  86.43 
 
 		 458 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  100 
 
 		 473 aa  932    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  70.86 
 
 		 450 aa  609  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  70.2 
 
 		 450 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  70.29 
 
 		 450 aa  597  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  68.35 
 
 		 482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  65.92 
 
 		 453 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  67.11 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  49.89 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  47.86 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  48.44 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  46.65 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  47.71 
 
 		 451 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  47.71 
 
 		 451 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  50.65 
 
 		 453 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  49.79 
 
 		 461 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  49.79 
 
 		 461 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  52.42 
 
 		 449 aa  359  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  50.43 
 
 		 461 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  45.88 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  49.79 
 
 		 453 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  45.21 
 
 		 446 aa  355  7.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  49.36 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  47.58 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  48.2 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  46.83 
 
 		 452 aa  353  5e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  49.57 
 
 		 441 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  50.64 
 
 		 453 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  46.7 
 
 		 445 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  42.58 
 
 		 448 aa  348  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  46.7 
 
 		 442 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  45.59 
 
 		 454 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  46.24 
 
 		 445 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  46.05 
 
 		 445 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  48.54 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  47.63 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  45.21 
 
 		 445 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  43.91 
 
 		 445 aa  329  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  43.4 
 
 		 451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  42.48 
 
 		 451 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  45.95 
 
 		 443 aa  299  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  42.95 
 
 		 451 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  38.59 
 
 		 590 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  38.68 
 
 		 590 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  36.23 
 
 		 616 aa  238  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  36.34 
 
 		 608 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  34.41 
 
 		 603 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  34.05 
 
 		 612 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  33.19 
 
 		 596 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  32.71 
 
 		 598 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  34.7 
 
 		 600 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  36.93 
 
 		 571 aa  223  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  39.11 
 
 		 607 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  34.33 
 
 		 600 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  34.54 
 
 		 627 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  35.53 
 
 		 599 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  40.33 
 
 		 596 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  41.78 
 
 		 619 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  41.24 
 
 		 587 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  39.18 
 
 		 588 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  39.84 
 
 		 581 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  42.46 
 
 		 562 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  40.97 
 
 		 584 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  35.92 
 
 		 578 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  38.76 
 
 		 570 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  38.7 
 
 		 575 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  38.7 
 
 		 575 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  38.7 
 
 		 575 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  39.85 
 
 		 596 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  39.72 
 
 		 574 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  39.72 
 
 		 574 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  39.72 
 
 		 574 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  40.17 
 
 		 561 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  38.81 
 
 		 560 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  42.94 
 
 		 562 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  39.94 
 
 		 578 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  34.33 
 
 		 587 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  37.9 
 
 		 594 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  36.08 
 
 		 580 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  35.41 
 
 		 587 aa  159  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  33.23 
 
 		 654 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  27.24 
 
 		 484 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  26.6 
 
 		 461 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  26.01 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  27.11 
 
 		 464 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0918925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>